SCBN

DOI:10.18129 / B9.bioc.SCBN

统计归一化法和微分表达式分析RNA-seq不同物种之间的数据

Bioconductor版本:版本(3.17)

这个包提供了一个基于规模的标准化(SCBN)方法来识别不同物种之间的基因差异表达。它考虑守恒的直系同源基因的可用知识和假设检验框架来检测差异表达同源基因。本文中描述的方法在这个包的一个统计RNA-seq数据的归一化法和微分表达式分析不同物种的燕周、朱Jiadi,铁军,冰清林Junhui Wang Jun张(2018年,即将出版)。

作者:燕周

维修工:燕周在email.szu.edu.cn < 2160090406 >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SCBN”)

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文档

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HTML	R脚本	SCBN教程
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细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,归一化,软件
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(4.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	统计数据
链接
建议	knitr rmarkdown,BiocStyle,BiocManager
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	TEKRABber
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	SCBN_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	SCBN_1.18.0.zip
macOS二进制(x86_64)	SCBN_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64)	SCBN_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SCBN
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SCBN
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/SCBN/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SCBN/
包下载报告	下载数据