RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp

DOI:10.18129 / B9.bioc.RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp

RcisTarget主题数据库对人类(hg19) - 4.6 k图案的子集

Bioconductor版本:版本(3.17)

RcisTarget数据库:基于基因的转录因子主题排名和注释。这个包包含了4.6 k图案的一个子集(cisbp图案),得分仅在500英国石油公司上游和TSS。看到RcisTarget教程下载完整的数据库,包含20 k图案和搜索空间10 kbp TSS。

作者:Sara Aibar,哥特Hulselmans, Aerts斯坦。计算生物学的实验室,KU鲁汶人类遗传学中心。比利时鲁汶。

维护人员:莎拉Aibar <萨拉。在kuleuven.vib.be aibar >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData,Homo_sapiens_Data
版本	1.20.0
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.3)
进口	data.table
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://scenic.aertslab.org
取决于我
进口我
建议我	RcisTarget
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp_1.20.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RcisTarget.hg19.motifDBs.cisbpOnly.500bp/
包下载报告	下载数据