RCM

DOI:10.18129 / B9.bioc.RCM

适合row-column协会与微生物的负二项分布模型

Bioconductor版本:版本(3.17)

结合对数线性的想法列联表分析,灵活的响应函数估计和分散经验贝叶斯估计对探险的微生物组数据集的可视化。包包括无约束以及约束分析。此外,诊断检测可用缺乏合适的阴谋。

作者:Stijn Hawinkel (cre, aut)

维护人员:Stijn Hawinkel < Stijn。在psb.ugent.be hawinkel >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(RCM)

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HTML	R脚本	RCM pacakage手册
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细节

biocViews	DimensionReduction,宏基因组,微生物组,软件,可视化
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(4年)
许可证	GPL-2
取决于	DBI R (> = 4.0)
进口	RColorBrewer、阿拉巴马州、刨边机,tseries reshape2统计、VGAM ggplot2 (> = 2.2.1.9000) nleqslv,phyloseq、张量、质量、grDevices、图形的方法
链接
建议	knitr、rmarkdown testthat
SystemRequirements
增强了
URL	//www.andersvercelli.com/packages/release/bioc/vignettes/RCM/inst/doc/RCMvignette.html/
BugReports	https://github.com/CenterForStatistics-UGent/RCM/issues
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	RCM_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	RCM_1.16.0.zip
macOS二进制(x86_64)	RCM_1.16.0.tgz
macOS二进制(arm64)	RCM_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RCM
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RCM
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/RCM/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RCM/
包下载报告	下载数据