QSutils

DOI:10.18129 / B9.bioc.QSutils

准物种多样性

Bioconductor版本:版本(3.17)

组病毒准物种的效用函数与门店数据分析。大多数函数都同样有用的宏基因组研究。有三个主要类型:(1)对转换读取数据操作和exploration-functions有用单体型频率,修复读取、交叉链单和可视化单体型排列。(2)多样性indices-functions计算多样性和熵,发病率,丰度,和功能指标。(3)病毒准物种生成随机的数据simulation-functions有用的数据。

作者:奔驰Guerrero-Murillo (cre, aut)约瑟Gregori我字体(aut)

维护人员:奔驰Guerrero-Murillo < mergumu gmail.com >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“QSutils”)

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文档

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HTML	R脚本	QSUtils-Alignment
HTML	R脚本	QSutils-Diversity
HTML	R脚本	QSutils-Simulation
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	对齐,DNASeq,DataImport,GeneticVariability,遗传学,SequenceMatching,测序,软件
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(4.5年)
许可证	文件许可证
取决于	R (> = 3.5),Biostrings,BiocGenerics、方法
进口	猿,统计,心理
链接
建议	BiocStyle,rmarkdown knitr ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	QSutils_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	QSutils_1.18.0.zip
macOS二进制(x86_64)	QSutils_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64)	QSutils_1.17.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/QSutils
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ QSutils
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/QSutils/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/QSutils/
包下载报告	下载数据