过去的

DOI:10.18129 / B9.bioc.PAST

通路协会研究工具(过去)

Bioconductor版本:版本(3.17)

过去需要GWAS产出和分配snp基因,利用这些基因找到途径与基因相关,根据意义和情节通路。实现的方法阅读GWAS输入数据,寻找相关基因单核苷酸多态性,计算浓缩分数和通路的重要性,和策划通路。

作者:研究亚当(cre, aut], DeOrnellis梅森(aut)

维修工:研究亚当在igbb.msstate.edu <研究>

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(过去)

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HTML	R脚本	过去的
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文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GeneSetEnrichment,通路,软件
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(4年)
许可证	GPL(> = 3) +文件许可证
取决于	R (> = 4.0)
进口	属性,跑龙套,dplyr rlang,迭代器,平行,foreach, doParallel,qvalue,rtracklayerggplot2,GenomicRanges,S4Vectors
链接
建议	knitr, rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/IGBB/past
BugReports	https://github.com/IGBB/past/issues
取决于我
进口我
建议我
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	PAST_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	PAST_1.16.0.zip
macOS二进制(x86_64)	PAST_1.16.0.tgz
macOS二进制(arm64)	PAST_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PAST
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/过去
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/PAST/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/PAST/
包下载报告	下载数据