Nebulosa

DOI:10.18129 / B9.bioc.Nebulosa

单细胞数据可视化使用内核Gene-Weighted密度估计

Bioconductor版本:版本(3.17)

这个包提供了一个增强的单细胞的可视化数据基于gene-weighted密度估计。Nebulosa复苏信号从退出功能,允许检查联合来自多个特性(如基因)的表达。在Nebulosa修和SingleCellExperiment对象可以使用。

作者:何塞Alquicira-Hernandez (aut (cre)

维修工:何塞Alquicira-Hernandez < alquicirajose gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“Nebulosa”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“Nebulosa”)

HTML	R脚本	可视化与Nebulosa基因表达
HTML	R脚本	基因表达的可视化与Nebulosa(修)
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DimensionReduction,GeneExpression,SingleCell,软件,可视化
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.0), ggplot2,拼凑
进口	修,SingleCellExperiment,SummarizedExperiment、ks矩阵、属性、方法
链接
建议	testthat,BiocStyle,rmarkdown knitr covr,嘘,食物,DropletUtilsigraph,BiocFileCache,SeuratObject
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/powellgenomicslab/Nebulosa
BugReports	https://github.com/powellgenomicslab/Nebulosa/issues
取决于我
进口我
建议我	scCustomize, SCpubr
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	Nebulosa_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	Nebulosa_1.10.0.zip
macOS二进制(x86_64)	Nebulosa_1.10.0.tgz
macOS二进制(arm64)	Nebulosa_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Nebulosa
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Nebulosa
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/Nebulosa/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/Nebulosa/
包下载报告	下载数据