GeneStructureTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.GeneStructureTools

拼接基因结构操作和分析的工具

Bioconductor版本:版本(3.17)

GeneStructureTools可用于创建在硅片可变剪接事件,并分析潜在影响对功能基因产物。

作者:贝丝信号

维护人员:贝丝信号< b。信号在garvan.org.au >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GeneStructureTools”)

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文档

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HTML	R脚本	介绍GeneStructureTools
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文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	AlternativeSplicing,DifferentialSplicing,FunctionalPrediction,ImmunoOncology,RNASeq,软件,转录组
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(5年)
许可证	BSD_3_clause +文件许可证
取决于
进口	Biostrings,GenomicRanges,IRanges、数据。表、plyr stringdist stringr,S4Vectors,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10,统计,跑龙套,Gviz,rtracklayer、方法
链接
建议	BiocStyle、knitr rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	GeneStructureTools_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	GeneStructureTools_1.20.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	GeneStructureTools_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64)	GeneStructureTools_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeneStructureTools
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GeneStructureTools
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/GeneStructureTools/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GeneStructureTools/
包下载报告	下载数据