GWAS.BAYES

DOI:10.18129 / B9.bioc.GWAS.BAYES

贝叶斯分析高斯GWAS数据

Bioconductor版本:版本(3.17)

这个包是建立执行GWAS使用贝叶斯技术分析。目前,GWAS。贝叶斯的实现功能BICOSS高斯表型(威廉姆斯,J。费雷拉,m。,和Ji, T. (2022). BICOSS: Bayesian iterative conditional stochastic search for GWAS. BMC Bioinformatics 23, 475). The research related to this package was supported in part by National Science Foundation awards DMS 1853549, DMS 1853556, and DMS 2054173.

作者:雅各布·威廉姆斯(aut (cre),马可·费雷拉(aut),当时吉(aut)

维修工:雅各布·威廉姆斯在vt.edu < jwilliams >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GWAS.BAYES”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GWAS.BAYES”)

HTML	R脚本	GWAS.BAYES
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	AssayDomain,贝叶斯,GenomeWideAssociation,单核苷酸多态性,软件
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.2.0)
进口	GA(> = 3.2),插入符号(> = 6.0 -86),memoise(> = 1.1.0),矩阵(1.2 > = -18),limma(> = 3.54.0),数据(> = 4.2.2),质量(> = 7.3 - -58.1)
链接
建议	BiocStyle,rmarkdown knitr formatR rrBLUP
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	GWAS.BAYES_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	GWAS.BAYES_1.10.0.zip
macOS二进制(x86_64)	GWAS.BAYES_1.10.0.tgz
macOS二进制(arm64)	GWAS.BAYES_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GWAS.BAYES
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GWAS.BAYES
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/GWAS.BAYES/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GWAS.BAYES/
包下载报告	下载数据