GSgalgoR

DOI:10.18129 / B9.bioc.GSgalgoR

进化框架预后基因表达特征的识别和研究癌症

Bioconductor版本:版本(3.17)

一个疾病子型多目标优化算法的发现基于non-dominated排序遗传算法。Galgo的框架结合了聚类算法的优点异质分组的组学数据和特征选择的遗传算法的搜索性能。的算法寻找最优簇数确定考虑到功能最大化生存亚型之间的区别,同时保持集群一致性高。

作者:马丁·格雷罗州(aut),卡洛斯卡塔尼亚(cre)

维护人员:卡洛斯卡塔尼亚< harpomaxx gmail.com >

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文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 分类,聚类,GeneExpression,软件,生存,转录
版本 1.10.0
Bioconductor自 BioC 3.12 (r - 4.0)(2.5年)
许可证 麻省理工学院+文件许可证
取决于
进口 集群、doParallel foreach、matchingR nsga2R,生存,代理,属性,方法
链接
建议 knitr、rmarkdown ggplot2,BiocStyle,genefu,survcomp,Biobasesurvminer,breastCancerTRANSBIG,breastCancerUPP,pamr iC10TrainingData testthat
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/harpomaxx/GSgalgoR
BugReports https://github.com/harpomaxx/GSgalgoR/issues
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包档案

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源包 GSgalgoR_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 GSgalgoR_1.10.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) GSgalgoR_1.10.0.tgz
macOS二进制(arm64) GSgalgoR_1.10.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSgalgoR
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GSgalgoR
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/GSgalgoR/
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/GSgalgoR/
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