GENIE3

DOI:10.18129 / B9.bioc.GENIE3

基因网络推理树的合奏

Bioconductor版本:版本(3.17)

这个包实现了GENIE3算法从表达数据推断基因调控网络。

作者:范·安Huynh-Thu Sara Aibar皮埃尔吉尔茨

维护人员:凡安Huynh-Thu < vahuynh在ulg.ac.be >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GENIE3”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GENIE3”)

HTML	R脚本	GENIE3
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DecisionTree,GeneExpression,GraphAndNetwork,网络,NetworkInference,回归,软件,SystemsBiology
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(5.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于
进口	统计数据、reshape2 dplyr
链接
建议	knitr, rmarkdown、foreach doRNG doParallel,Biobase,SummarizedExperiment、testthat、方法
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	BioNERO,MetNet
建议我	dnapath
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	GENIE3_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	GENIE3_1.22.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	GENIE3_1.22.0.tgz
macOS二进制(arm64)	GENIE3_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GENIE3
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GENIE3
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/GENIE3/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GENIE3/
包下载报告	下载数据