GA4GHshiny

DOI:10.18129 / B9.bioc.GA4GHshiny

闪亮的申请与GA4GH-based数据服务器交互

Bioconductor版本:版本(3.17)

GA4GHshiny包提供了一种简便的方法与数据服务器进行交互基于基因组学和全球联盟健康(GA4GH)基因组学API通过一个闪亮的应用程序。它还集成了信标网络。

作者:Welliton Souza (aut (cre) Benilton卡瓦略(施),克莉斯婷罗查[所有],伊丽莎白Borgognoni(施)

维护人员:Welliton Souza < well309 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GA4GHshiny”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GA4GHshiny”)

HTML	R脚本	GA4GHshiny
PDF		参考手册

细节

biocViews	GUI,软件
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(5.5年)
许可证	GPL-3
取决于	GA4GHclient
进口	AnnotationDbi,BiocGenericsdplyr, DT,GenomeInfoDbopenxlsx,GenomicFeatures、方法、purrrS4Vectors闪亮的、shinyjs tidyr shinythemes
链接
建议	BiocStyle,org.Hs.eg.db,rmarkdown knitr testthat,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/labbcb/GA4GHshiny
BugReports	https://github.com/labbcb/GA4GHshiny/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	GA4GHshiny_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	GA4GHshiny_1.22.0.zip
macOS二进制(x86_64)	GA4GHshiny_1.22.0.tgz
macOS二进制(arm64)	GA4GHshiny_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GA4GHshiny
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GA4GHshiny
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/GA4GHshiny/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GA4GHshiny/
包下载报告	下载数据