FunChIP

DOI:10.18129 / B9.bioc.FunChIP

集群和对齐的ChIP-Seq山峰根据他们的形状

Bioconductor版本:版本(3.17)

预处理和平滑ChIP-Seq高峰和k-mean对齐算法的高效实现分类。

作者:爱丽丝Parodi (aut (cre),马可Morelli (aut (cre),劳拉·m·Sangalli (aut) Piercesare西奇(aut),西蒙Vantini (aut)

维护人员:爱丽丝Parodi < alicecarla。在polimi.it parodi >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“FunChIP”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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PDF	R脚本	介绍FunChIP
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文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq,聚类,软件,StatisticalMethod
版本	1.26.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(7年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0),GenomicRanges
进口	闪亮的,fda、doParallelGenomicAlignments、Rcpp方法、foreach平行,GenomeInfoDb,Rsamtools,图形、属性、RColorBrewer grDevices
链接	Rcpp
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	FunChIP_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	FunChIP_1.26.0.zip
macOS二进制(x86_64)	FunChIP_1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64)	FunChIP_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FunChIP
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ FunChIP
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/FunChIP/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/FunChIP/
包下载报告	下载数据