FScanR

DOI:10.18129 / B9.bioc.FScanR

从信使rna检测程序核糖体移码事件/ cDNA BLASTX输出

Bioconductor版本:版本(3.17)

“FScanR”标识程序从BLASTX核糖体移码(脉冲)事件相同器官之间的序列比对目标基因互补/信使rna序列肽库的同种或近亲属。输出由BLASTX或钻石BLASTX将被用作输入的“FScanR”,应该在14列的表格格式。BLASTX,输出参数应该是:-outfmt”6 qseqid sseqid pident长度不匹配gapopen qstart qend sstart发送安勤科技bitscore qframe sframe”。对于钻石BLASTX,输出参数应该是:-outfmt 6 qseqid sseqid pident长度不匹配gapopen qstart qend sstart发送安勤科技bitscore qframe qframe。

作者:小陈(aut (cre)

维护人员:小陈< seanchen607 gmail.com >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“FScanR”)

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HTML	R脚本	FScanR
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细节

biocViews	对齐,注释,软件
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.0)
进口	统计数据
链接
建议	knitr, rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/seanchen607/FScanR/issues
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	FScanR_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	FScanR_1.10.0.zip
macOS二进制(x86_64)	FScanR_1.10.0.tgz
macOS二进制(arm64)	FScanR_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FScanR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ FScanR
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/FScanR/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/FScanR/
包下载报告	下载数据