DeMixT

DOI:10.18129 / B9.bioc.DeMixT

细胞特定类型反褶积的异构肿瘤样本与两个或三个组件使用表达式RNAseq或微阵列平台的数据

Bioconductor版本:版本(3.17)

DeMixT软件包,执行反褶积在转录组数据来自两个或三个组件的混合物。

作者:王结雅河边上,< zw17。大米在gmail.com >,曹Shaolong < scao mdanderson.org >, Wenyi王在mdanderson.org < wwang7 >

维护人员:帅郭<帅。郭:uth.tmc.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DeMixT”)

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文档

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HTML	R脚本	DeMixT.Rmd
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细节

biocViews	分类,报道,GeneExpression,微阵列,测序,软件,StatisticalMethod,TissueMicroarray
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(4年)
许可证	GPL-3
取决于	R(> = 3.6.0),并行,Rcpp (> = 1.0.0),SummarizedExperiment,KernSmooth knitr matrixcalc rmarkdown,DSSdendextend心理,股东价值分析
进口	matrixStats,统计、truncdist base64enc ggplot2
链接	Rcpp
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	DeMixT_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	DeMixT_1.16.0.zip
macOS二进制(x86_64)	DeMixT_1.16.0.tgz
macOS二进制(arm64)	DeMixT_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DeMixT
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DeMixT
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/DeMixT/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/DeMixT/
包下载报告	下载数据