反编排

DOI:10.18129 / B9.bioc.DEFormats

差异基因表达数据格式转换器

Bioconductor版本:版本(3.17)

所使用的不同数据格式之间的转换差异基因表达分析工具。

作者:Andrzej Oleś

维护人员:Andrzej Oleś< Andrzej。ole gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“反编排”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“反编排”)

HTML	R脚本	差异基因表达数据格式转换器
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文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,转录
版本	1.28.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(7年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	data.table挫败,DESeq2,刨边机(> = 3.13.4),GenomicRanges、方法、S4Vectors统计数据,SummarizedExperiment
链接
建议	BiocStyle(> = 1.8.0)、knitr rmarkdown testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/aoles/DEFormats
BugReports	https://github.com/aoles/DEFormats/issues
取决于我
进口我	regionReport
建议我	理想的
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	DEFormats_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	DEFormats_1.28.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	DEFormats_1.28.0.tgz
macOS二进制(arm64)	DEFormats_1.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DEFormats
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/反编排
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/DEFormats/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/DEFormats/
包下载报告	下载数据