CluMSID

DOI:10.18129 / B9.bioc.CluMSID

集群的代谢物鉴定一份光谱

Bioconductor版本:版本(3.17)

CluMSID艾滋病是一种工具,没有针对性的识别特性质/ MS分析通过使用一份光谱相似性和无监督的统计方法。它提供了功能完整的和可定制的工作流从原始数据到数据可视化和与xmcs interfaceable预处理方案的家庭。

作者:Tobias Depke (aut (cre) Raimo因特网(施),马克Broenstrup(黑色)

维护人员:Tobias Depke < Depke mailbox.org >

从内部引用(R,回车引用(“CluMSID”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CluMSID”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

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PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 聚类,代谢组学,预处理,软件
版本 1.16.0
Bioconductor自 BioC 3.9 (r - 3.6)(4年)
许可证 麻省理工学院+文件许可证
取决于 R (> = 3.6)
进口 mzR,S4Vectors,dbscan RColorBrewer猿、网络GGally, ggplot2,阴谋,方法,跑龙套,统计数据,系统网络体系结构(sna)中,grDevices,图形,Biobasegplots,MSnbase
链接
建议 knitr、rmarkdown testthat、dplyr readr, stringr, magrittr,CluMSIDdata,metaMS,metaMSdata,xcms
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/tdepke/CluMSID
BugReports https://github.com/tdepke/CluMSID/issues
取决于我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包 CluMSID_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 CluMSID_1.16.0.zip
macOS二进制(x86_64) CluMSID_1.16.0.tgz
macOS二进制(arm64) CluMSID_1.16.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CluMSID
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CluMSID
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/CluMSID/
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/CluMSID/
包下载报告 下载数据

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