ADAMgui

DOI:10.18129 / B9.bioc.ADAMgui

活动和多样性分析模块的图形用户界面

Bioconductor版本:版本(3.17)

ADAMgui亚当是一个图形用户界面的包。ADAMgui包提供2 shiny-based应用程序允许用户研究亚当包文件的输出通过不同的情节。这是有可能的,例如,选择一个特定的GFAG和观察基因表达行为GFAGtargetUi函数创建的情节。特性,比如微分表达式和foldchange可以很容易地看到与援助的情节由GFAGpathUi函数。

作者:布鲁诺Sanches入股事宜(aut),安德烈·路易斯Molan[所有],艾格尼丝武田[所有],何塞Rybarczyk球场(cre施,年代)

维护人员:何塞•路易斯Rybarczyk球场<何塞。路易斯在unesp.br >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ADAMgui”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“ADAMgui”)

HTML	R脚本	使用ADAMgui
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文本		新闻

细节

biocViews	GeneSetEnrichment,KEGG,通路,软件
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(4年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> = 3.6),统计,跑龙套,方法,亚当
进口	GO.db(> = 3.5.0)dplyr(> = 0.7.6),闪亮的(> = 1.1.0),stringr (> = 1.3.1) stringi (> = 4) varhandle (> = 2.0.3) ggplot2 (> = 3.0.0), ggrepel (> = 0.8.0) ggpubr (> = 0.1.8) ggsignif (> = 0.4.0) reshape2 (> = 3), RColorBrewer (> = 1.1 2), colorRamps (> = 2.3), DT(> = 0.4),数据。表(> = 1.11.4)gridExtra (> = 2.3), shinyjs (> = 1.0), knitr testthat
链接
建议	减价,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	稍后通知
BugReports	https://github.com/jrybarczyk/ADAMgui/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	ADAMgui_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	ADAMgui_1.16.0.zip
macOS二进制(x86_64)	ADAMgui_1.16.0.tgz
macOS二进制(arm64)	ADAMgui_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ADAMgui
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ADAMgui
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ADAMgui/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ADAMgui/
包下载报告	下载数据