cytofkit

DOI:10.18129 / B9.bioc.cytofkit

Cytofkit:集成的海量细胞仪数据分析管道

Bioconductor版本:Release (3.6)

一个集成的大规模细胞术数据分析管道，能够同时说明细胞的多样性和进展。

作者:陈金淼，陈浩，Matthew Myint

维护人员:Jinmiao Chen ， Hao Chen ， Matthew Myint

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文档

超文本标记语言	R脚本	分析管道
超文本标记语言	R脚本	快速启动
超文本标记语言	R脚本	ShinyAPP教程
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细节

biocViews	BiomedicalInformatics，CellBiology，聚类，DimensionReduction，FlowCytometry，GUI，软件
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.4.0)，ggplot2，plyr
进口	tcltk, grDevices，图形，utils，统计，Rtsne，e1071，flowCore，gplots，colourpicker，VGAM，reshape2，ggrepel，闪亮的，shinyFiles，素食主义者，Biobase，doParallel平行,pdist、方法、命运，FlowSOM(> = 1.4.0),igraph(> = 1.1.2),RANN(> = 2.5),Rcpp(> = 0.12.0)
链接	Rcpp
建议	knitr，RUnit，testthat，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/JinmiaoChenLab/cytofkit
BugReports	https://github.com/JinmiaoChenLab/cytofkit/issues
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	cytofkit_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	cytofkit_1.10.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	cytofkit_1.10.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cytofkit
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/cytofkit/
软件包下载报告	下载数据