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这是发展削弱了的版本;稳定的发布版本请参见削弱了．

预后特征的显著性分析

生物导体版本:开发(3.4)

实现预后签名显著性分析方法(SAPS)的功能。SAPS提供了一种强大的方法来识别与患者生存相关的生物学上重要的基因集。计算了三个基本统计。首先，根据候选基因的差异表达将患者分为两个生存组。P_pure被计算为两组之间没有生存差异的概率。接下来，对随机生成的基因集应用相同的过程，计算P_random作为使P_pure与候选基因集具有显著性的比例。最后，通过一致性指数对所有基因进行排序，进行预排序基因集富集分析(GSEA)，并计算P_enrich来表示具有单变量预后显著性基因的候选基因集富集程度。计算一个SAPS_score来总结这三个统计数据，并可选地计算一个q值，通过计算随机基因集的SAPS_scores来估计SAPS_score的显著性。

作者:Daniel Schmolze [aut, cre]， Andrew Beck [aut]， Benjamin Haibe-Kains [aut]

维护人员:Daniel Schmolze

安装

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文档

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超文本标记语言	R脚本	削弱了装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	BiomedicalInformatics，DifferentialExpression，GeneExpression，GeneSetEnrichment，软件，生存
版本	2.5.2
Bioconductor自	BioC 3.1 (R-3.2)(1.5年)
许可证	MIT +文件许可
取决于	R (> = 2.14.0),生存
进口	钢琴，survcomp，reshape2
链接
建议	降雪，knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	saps_2.5.2.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/saps
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/saps/
包下载报告	下载数据