要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“eisa”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见eisa.
Bioconductor版本:3.4
迭代签名算法(ISA)是一种聚类方法;它在基因表达(或其他表格)数据中找到相关的块(转录模块)。ISA能够发现重叠模块,并具有抗噪声能力。这个包提供了一个方便的ISA接口,使用标准的BioConductor数据结构;并且还包含了各种可视化工具,可以与其他双聚类算法一起使用。
作者:Gabor Csardi < Csardi。Gabor在gmail.com>
维护者:Gabor Csardi < Csardi。Gabor在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(eisa)):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“eisa”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes (eisa)
| R脚本 | 基因表达数据的迭代签名算法 | |
| 参考手册 |
| biocViews | 分类,GeneExpression,微阵列,软件,可视化 |
| 版本 | 1.26.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.6 (R-2.11)(7年) |
| 许可证 | GPL (>= 2) |
| 取决于 | isa2,Biobase(> = 2.17.8),AnnotationDbi、方法 |
| 进口 | BiocGenerics,类别,genefilter,DBI |
| 链接 | |
| 建议 | igraph(> = 0.6),矩阵,GOstats,GO.db,KEGG.db,biclust,质量,xtable,所有,hgu95av2.db,targetscan.Hs.eg.db,org.Hs.eg.db |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | ExpressionView |
| 进口我 | ExpressionView |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
| 包的来源 | eisa_1.26.0.tar.gz |
| Windows二进制 | eisa_1.26.0.zip |
| Mac OS X 10.9 (Mavericks) | eisa_1.26.0.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/eisa/tree/release-3.4 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/eisa/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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