要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ pcaexplorer”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

PCAEXPLORER

该包适用于生物导体的3.3版;对于稳定的最新版本,请参阅PCAEXPLORER

使用主要组件方法对RNA-SEQ数据进行交互式可视化

生物导体版本:3.3

该软件包提供了基于主组件分析的RNA-Seq数据集的交互式可视化功能。提供的方法可以快速提取信息和有效的数据探索。闪亮的应用程序封装了整个分析。

作者:费德里科·马里尼(Federico Marini)[AUT,CRE]

维护者:uni-mainz.de>的Federico Marini

引用(从r内,输入引用(“ pcaexplorer”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ pcaexplorer”)

文档

html R脚本 PCAExplorer用户指南
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 维度,,,,GUI,,,,委托人,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,软件,,,,可视化
版本 1.0.2
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(<6个月)
执照 麻省理工学院 +文件许可证
要看
进口 deseq2,,,,总结性特征,,,,基因组机,,,,iranges,,,,S4VECTORS,,,,GeneFilter,,,,GGPLOT2(> = 2.0.0),D3 -HeatMap,,,,,,,,NMF,,,,plyr,,,,topgo,,,,林玛,,,,gostats,,,,go.db,,,,AnnotationDbi,,,,闪亮的(> = 0.12.0),发光的dashboard,,,,丝绸,,,,Ggrepel,,,,DT,grdevices,方法
链接
建议 尼特,,,,测试,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,呼吸道,,,,org.hs.eg.db
系统要求
增强
URL https://github.com/federicomarini/pcaexplorer
BugReports https://github.com/federicomarini/pcaexplorer/issues
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 pcaexplorer_1.0.2.tar.gz
Windows二进制 pcaexplorer_1.0.2.zip
Mac OS X 10.9(Mavericks) pcaexplorer_1.0.2.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/pcaexplorer/tree/release-3.3
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/pcaexplorer/
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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
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