要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ pcaexplorer”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
该包适用于生物导体的3.3版;对于稳定的最新版本,请参阅PCAEXPLORER。
生物导体版本:3.3
该软件包提供了基于主组件分析的RNA-Seq数据集的交互式可视化功能。提供的方法可以快速提取信息和有效的数据探索。闪亮的应用程序封装了整个分析。
作者:费德里科·马里尼(Federico Marini)[AUT,CRE]
维护者:uni-mainz.de>的Federico Marini
引用(从r内,输入引用(“ pcaexplorer”)):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ pcaexplorer”)
| html | R脚本 | PCAExplorer用户指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
| 生物浏览 | 维度,,,,GUI,,,,委托人,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,软件,,,,可视化 |
| 版本 | 1.0.2 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(<6个月) |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件许可证 |
| 要看 | |
| 进口 | deseq2,,,,总结性特征,,,,基因组机,,,,iranges,,,,S4VECTORS,,,,GeneFilter,,,,GGPLOT2(> = 2.0.0),D3 -HeatMap,,,,秤,,,,NMF,,,,plyr,,,,topgo,,,,林玛,,,,gostats,,,,go.db,,,,AnnotationDbi,,,,闪亮的(> = 0.12.0),发光的dashboard,,,,丝绸,,,,Ggrepel,,,,DT,grdevices,方法 |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特,,,,测试,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,呼吸道,,,,org.hs.eg.db |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/federicomarini/pcaexplorer |
| BugReports | https://github.com/federicomarini/pcaexplorer/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | pcaexplorer_1.0.2.tar.gz |
| Windows二进制 | pcaexplorer_1.0.2.zip |
| Mac OS X 10.9(Mavericks) | pcaexplorer_1.0.2.tgz |
| 颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/pcaexplorer/tree/release-3.3 |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/pcaexplorer/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |