要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“limma”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

limma

这个包适用于Bioconductor 2.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见limma

微阵列数据的线性模型

Bioconductor版本:2.9

微阵列数据的数据分析,线性模型和微分表达式。

作者:Gordon Smyth, Matthew Ritchie, Jeremy Silver, James Wettenhall, Natalie Thorne, Mette Langaas, Egil Ferkingstad, Marcus Davy, Francois Pepin, Dongseok Choi, Davis McCarthy, Di Wu, Alicia Oshlack, Carolyn de Graaf, Yifang Hu, Wei Shi和Belinda Phipson。

维护者:Gordon Smyth < Smyth at wehi.edu.au>

引文(从R内,输入引用(“limma”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“limma”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“limma”)

PDF limma.pdf
PDF usersguide.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews 生物信息学DataImportDifferentialExpression微阵列MultipleComparisonsOneChannel预处理质量控制软件TimeCourseTwoChannel
版本 3.10.3
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年)
许可证 LGPL
取决于 R(>= 2.3.0),方法
进口
链接
建议 affy质量org.Hs.eg.db样条函数,statmod(> = 1.2.2),vsn
SystemRequirements
增强了
URL http://bioinf.wehi.edu.au/limma
全靠我 a4BaseAffyExpressaffylmGUIAgi4x44PreProcessAgiMicroRna吸引CALIB亚兰cghMCRChIPpeakAnnoclippdacodelink转换CormotifcoRNAi刨边机HTqPCRlimmaGUILVSmiRNA时间的maigesPackmarrayMmPalateMiRNAnemqpcrNorm林格RMAGEMLRTools4TBsnapCGHTurboNorm
进口我 affycoretoolsArrayExpressarrayQualityarrayQualityMetricsArrayTools吸引beadarrayBeadArrayUseCasesbetrCALIBChIPpeakAnnoDiffBindexploraseGeneSelectMMDGeneSelectorHTqPCRiChipmaSigProminfiMmPalateMiRNA奥林PatientGeneSetsphenoTest林格RNAinteractRNAitherRToppersnapCGHSSPAtimecoursetweeDEseqvsn
建议我 ABarraybeadarraySNPBiocCaseStudies生命网络类别CMAdyebiasGeneSelectorGEOqueryGSRIGSVAHeatplus莱斯光民methylumi中长期规划益生元oneChannelGUIPGSEAplwPREDA彪马RTopperrtracklayer股东价值分析
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 limma_3.10.3.tar.gz
Windows二进制 limma_3.10.3.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/limma/tree/release-2.9
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/limma/
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