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EDGER
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41
视图
关于使用glmqlfit时lib.sizes的问题
glmqlfit
EDGER
7小时前
史蒂夫·佩德森
•170
•4小时前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
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93
视图
在DE中考虑鱼类体重?
基因表达
EDGER
7天前
迈克尔·劳伦斯
•0
•5天前更新
詹姆斯·W·麦克唐纳
55k
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92
视图
RNASEQ上的差分表达无重复
deseq2
Noingsq
EDGER
22天前
主题
•0
•20天前更新
Atpoint
•390
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92
视图
用于可变调整的添加剂模型
EDGER
29天前
Science555111
•0
•29天前更新
云陈陈
•690
2
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109
视图
解决多因素实验中的批处理效应
EDGER
批处理效应
rnaseq
6周前
Anikng
•0
•5周前更新
萨姆格
•250
0
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2
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69
视图
“ Trinity-differental-Expression”对标准化原始计数的工作状况如何,而无需RSEM丰度
三位一体
差异性
RSEM
rnaseq
EDGER
5周前
哈雷拉里克
•50
1
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5
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138
视图
EDGER适用于Humannn2的Metatranscriptomics的差异丰度吗?
EDGER
Humann2.0
6周前
缺口
•0
1
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3
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196
视图
log2FC计算EDGER
EDGER
log2fc
14个月前
Matteo.buti
•0
1
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2
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82
视图
烤(FRY)基因集测试与偏移
EDASEQ
EDGER
林玛
6周前
gprezza
•0
0
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0
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71
视图
使用EDGER的组织特异性差异表达 - 考虑模型中其他效果
EDGER
差异性
7周前
克里斯蒂
•0
0
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3
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121
视图
基因表达与表型之间的皮尔逊相关性
EDGER
rnaseq
7周前
魏奇
•0
•7周前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
2
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133
视图
样本内基因相关性的归一化
EDGER
正常化
deseq2
TPM
rnaseq
7周前
tcalvo
•40
•7周前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
2
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2
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116
视图
EDGER的治疗和性
EDGER
7周前
Science555111
•0
•7周前更新
史蒂夫·利亚诺格洛(Steve Lianoglou)
13k
5
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3
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126
视图
Edger支持连续的协变量?
EDGER
9周前
常春藤
•0
0
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3
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131
视图
EDGER :: FILLEBYEXPR()返回意外结果
EDGER
11周前
Axel
•0
•9周前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
4
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83
视图
无重复分析的EDGER分析 - 如何使用集合分散值运行精确的测试?
EDGER
9周前
伯特布
•0
•9周前更新
詹姆斯·W·麦克唐纳
55k
0
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3
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69
视图
EDGER的偏移和标准化
EDGER
差异性
10周前
Ognjen011
•0
•9周前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
1
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8
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230
视图
EDGER中的尖峰融合
Cutandrun
EDGER
正常化
斯派金
chipseq
10周前•9周前更新
赫什
•0
0
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1
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72
视图
使用DESEQ/EDGER来估计相对于对照的差异表达。
EDGER
差异性
10周前
各向异性
•0
•10周前更新
迈克尔·洛夫
31k
0
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1
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53
视图
EDGER RRB估计的ISP永远运行,似乎还没有完成
EDGER
10周前
阿奇纳
•0
•10周前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
1
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1
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75
视图
ATAC-SEQ计数提取的差异
esatac
EDGER
差异
10周前
蒂莫西
•0
•10周前更新
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
2
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2
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124
视图
对数转换或不转换因变量/协变量
林玛
EDGER
11周前
anna.cot.anna.cot
•30
•10周前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
2
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10
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187
视图
在组之间和内部的EDGER上配对的时间课程实验设计
EDGER
diffcyt
林玛
差异性
10周前
哈哈
•0
2
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2
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129
视图
对RIN值调整的配对分析
林玛
EDGER
11周前
anna.cot.anna.cot
•30
•11周前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
3
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2
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168
视图
Catchsalmon用于TX级DE
捕获的捕获
EDGER
11周前
Atpoint
•390
7
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8
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283
视图
如何直接从最新EDGER中直接从DGELIST对象获得RPKM的基因长度?
正常化
EDGER
RPKM
11周前
Anikng
•0
•11周前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
1
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0
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60
视图
饮食后代谢物水平相关的差异基因表达
EDGER
11周前
anna.cot.anna.cot
•30
1
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3
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105
视图
滤波器因子DGELIST
EDGER
11周前
dojo89
•0
•11周前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
2
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3
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85
视图
EDGER设计矩阵用于mutlifactor RNA SEQ
EDGER
设计
多因素
12周前
Jackiesalzbank
•0
•12周前更新
詹姆斯·W·麦克唐纳
55k
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201
视图
EDGER DIFFSPLICEDGE:获得外显子级计数和归一化步骤
EDGER
正常化
差分外显子的使用
剪接
12周前
奥克汉姆狼
•0
•12周前更新
云陈陈
•690
0
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120
视图
具有推断重复的单细胞数据的EDGER
EDGER
鲰
3个月前•更新12周前
Atpoint
•390
0
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4
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144
视图
当传递给Limma/Edger时,我应该如何处理从SGSEQ派生的读数
sgseq
林玛
EDGER
3个月前
Zliu
•0
•3个月前更新
伦纳德·戈德斯坦
•110
0
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8
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164
视图
在DIFFSPLICEDGE中指定对比度以测试嵌套效果
diffsplicedge
对比矩阵
EDGER
3个月前
雷切尔(Rachel)
•0
•3个月前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
3
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3
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173
视图
任何时间都要了解互动的问题
RNA-seq
EDGER
互动
3个月前
vm. -Higareda
•10
•3个月前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
1
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1
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160
视图
在Edger中,我应该如何衡量BCV图的结果,常见分散的值,Tagwise Discerser,ECT。
EDGER
3个月前
Science555111
•0
10
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10
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220
视图
RNA-seq分析与Limma/Edger,时间课程实验,异常结果
林玛
EDGER
3个月前
astigliani31
•10
•3个月前更新
詹姆斯·W·麦克唐纳
55k
3
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1
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100
视图
如何在EDGER中创建目标数据框?
EDGER
RNA-seq
3个月前
Terra
•0
•3个月前更新
詹姆斯·W·麦克唐纳
55k
5
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2
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167
视图
饮食后血液参数变化相关的差异基因表达
EDGER
3个月前
anna.cot.anna.cot
•30
•3个月前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
6
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4
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146
视图
EDGER和批处理效果
EDGER
3个月前
Chatterjee.Arumoy
•10
•3个月前更新
史蒂夫·利亚诺格洛(Steve Lianoglou)
13k
6
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5
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157
视图
使用RNASEQ数据计算一些基因的标准偏差
EDGER
rnaseq
3个月前
玛哈伊
•0
•3个月前更新
史蒂夫·利亚诺格洛(Steve Lianoglou)
13k
3
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6
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115
视图
EDGER设计矩阵具有3个因素
EDGER
Glm
rnaseq
3个月前
Jackiesalzbank
•0
•3个月前更新
詹姆斯·W·麦克唐纳
55k
1
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1
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116
视图
WGCNA的技术复制
EDGER
4个月前
ava_jm75
•0
•4个月前更新
彼得·兰菲尔德
♦2.6k
7
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4
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172
视图
稀疏数据集上的TMM归一化
EDGER
林玛
4个月前
JC235601
•20
1
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4
答复
116
视图
尝试使用EDGER和表达数据进行PCA
EDGER
表达数据
PCA
4个月前
怀有
•0
•4个月前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
3
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4
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164
视图
如何理解CPM = 1以及FilterByExpr的工作方式?
EDGER
4个月前
Linouhao
•0
•4个月前更新
凯文·布莱(Kevin Blighe)
2.3k
1
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2
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125
视图
三个生物学重复的EISAR设置
艾萨尔
EDGER
4个月前
Nishanthemje
•0
•4个月前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
2
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2
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114
视图
EDGER中的RNA-seq时间序列分析
EDGER
时间序列分析
4个月前
乔斯曼特雷斯
•10
•4个月前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
1
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3
答复
125
视图
使用EDGER来自计数矩阵的TMM归一化矩阵
EDGER
4个月前
Hyojin0912
•0
•4个月前更新
戈登·史密斯(Gordon Smyth)
41k
0
投票
1
回复
55
视图
做Cox和KM情节
林玛
EDGER
4个月前
Linouhao
•0
•4个月前更新
凯文·布莱(Kevin Blighe)
2.3k
0
投票
2
答复
75
视图
如何在球门中标准化数据?
r
正常化
EDGER
4个月前
lakshmi9c
•0
•4个月前更新
詹姆斯·W·麦克唐纳
55k
1,655个结果•页面
34中的1
最近的 ...
答复
评论:R错误:软件包“ GenomeInfodb”无法在MacBook上加载
经过
担
•10
嗨,马丁,谢谢您的答复。我从https://cran.r-project.org/bin/macosx/下载了最新版本。
评论:学习差异 - 一些基本问题
经过
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
当“ summits = false”时,不一定会有更少的峰值。在您的情况下发生的事情是您已指定…
评论:使用LM功能线性模型使用正确计数
经过
迈克尔·洛夫
31k
是的,我没有太多的想法。在“ deseq2 :: umix”中,我们估计了计数的混合比例,我们认为这种关系是……
答:差异可以正确地指定峰值的峰值,折叠很小为statis
经过
迈克尔·洛夫
31k
在DESEQ2中,如果您不希望小效应大小出现在DE结果中,则可以使用“ lfcthreshold”。请参阅DESEQ2小插图(或纸)。
评论:在DIFFBIND中加载DBA对象的0字节床文件时错误报告
经过
罗里·史塔克(Rory Stark)
♦3.5k
通常,您不会将对比度与`dba.plotvenn()`,您通过2、3或4个样本。如果您有两个重复的条件,…
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评论:学习差异 - 一些基本问题
评论:R错误:软件包“ GenomeInfodb”无法在MacBook上加载
评论:DESEQ2 V1.30的验证结果
答案:使用GLMQLFIT时lib的问题
C:Camerapr vs Genesettest和烤/相机
奖项
• 全部
流行问题
至
HWU12
•10
流行问题
至
HWU12
•10
好问题
至
Svlachavas
•770
流行问题
至
ReubenmcGregor88
•0
预言家
至
DAW277
•0
位置
• 全部
德国,
9分钟前
Embl Heidelberg / de.nbi,
16分钟前
美国,
26分钟前
美国,
27分钟前
挪威卑尔根大学
31分钟前
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