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玛哈卜•0
@ marhabaie-16361
最后看见6个月前
是否有一种方法来计算来自RNASEQ数据的少数基因(〜10)的标准偏差,标准误差或95%的置信区间?我将RNASEQ折叠变化值与QPCR DDCT进行比较,并且需要为RNASEQ FC值显示一些不确定性的量度。需要将错误栏添加到此图表我希望能够从Edger获得一些不确定性的衡量标准(我曾经得到了de基因),但据我所知,Edger使用除去不是我所需要的。
谢谢,
我不是这个专家,但是afaik无法获得错误或置信区间。看到这个线程。https://support.biocumon.org/p/61640/
这似乎并不与任何生物导体包(?)有关,即使您已标记为Edger。似乎你可能想要的
geom_errorbar()
从ggplot2.但是,再次,这与任何生物导体封装不相关。对不起,不清楚。我刚刚编辑了这个问题。我希望能够从我曾经获得de基因的edger中得到它。我的问题不是如何绘制,而是用于计算错误的数据。
在更仔细的仔细观察后,我意识到最终我想计算QPCR和RNASEQ数据之间的相关性。为此,我不需要错误栏,因为它们在此处不相关时计算相关性。我对么?