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2
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3.
答案
201.
意见
DESEQ2:具有不同条件和重复的多重比较
互动
deseq2.
设计
3个月前更新
Kevin Blighe.
2.8K•写3个月前
vanbelj
▴10
0.
投票
1
回复
73
意见
4个不同的公式,但4倍相同的热图…
deseq2
设计
公式
5个月前更新
迈克尔爱
5个月前写的
b
▴10
2
投票
3.
答案
127.
意见
用于笨蛋RNA SEQ的编辑器设计矩阵
刨边机
设计
多因素
6个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
6个月前写的
jackiesalzbank
•0
0.
投票
5.
答案
166
意见
DESEQ2具有分层群集的问题
deseq2
设计
7个月前更新
Kevin Blighe.
2.8k•7个月前写的
mhnidhi2-c
•0
2
投票
5.
答案
191
意见
挑选正确的设计配方
deseq2
设计
实验
7个月前
Donnenfieldjonah.
•0
2
投票
5.
答案
271
意见
如何合并批处理效果,该效果仅在一个级别呈现到设计中?
线性模型
批处理效果
deseq2.
设计
8个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56K•写8个月前
蒂姆..
•0
2
投票
8.
答案
426.
意见
去除批效应limma、“系数不可估计”警告和设计矩阵
林马
deseq2
批处理
设计
批处理效果
8个月前
彼得罗
▴30.
4.
投票
7.
答案
148
意见
基因在一种情况下比在其他任何一种情况下都上调
刨边机
设计
9个月前更新
戈登·斯密
42K•9个月前写的
dario.beraldi
•0
0.
投票
1
回复
108.
意见
不可估计的系数往往带有多个数值协变量
R.
林马
设计
rnaseq.
变焦
10个月前更新
戈登·斯密
42k•写于10个月前
将
•0
2
投票
7.
答案
182
意见
多变量Limma分析
林马
model.matrix
德
设计
rnaseq.
10个月前更新
戈登·斯密
42k•写于10个月前
将
•0
6.
投票
6.
答案
182
意见
用相同生物实体的多个样本分析实验的设计
rna-seq
设计
线性模型
GLM.
14个月前更新
史蒂夫Lianoglou
13K•14个月前写的
TMMS.
•0
0.
投票
10.
答案
192
意见
DEseq2设计配方批改
deseq2
设计
公式
批处理效果
14个月前更新
Swbarnes2.
▴680•14个月前写的
L.rijnberk.
•0
1
投票
4.
答案
125.
意见
帮助Deseq2设计
deseq2
设计
多因素
14个月前更新
迈克尔爱
32k•14个月前写的
SXP585.
•0
1
投票
1
回复
503.
意见
lfcshrink不适用于对比
lfcshrink.
对比
设计
deseq2
15个月前更新
迈克尔爱
15个月前写的
亚萨合Yeroslaviz
★1.5K.
0.
投票
2
答案
106.
意见
DESeq2时程实验设计
deseq2
设计
设计公式
时间课程
轻轨车
15个月前更新
迈克尔爱
15个月前写的
Ac_bioinformatics.
•0
2
投票
1
回复
90
意见
在DESeq2中进行组合柱实验设计
deseq2
设计
元数据
15个月前更新
sebastian.lobentanzer.
▴50•15个月前写的
亚萨合Yeroslaviz
★1.5K.
1
投票
8.
答案
1.0克
意见
DESeq2:设计中的连续变量和离散变量
deseq2
R.
rna-seq
设计
3个月前更新
迈克尔爱
32K•16个月前写的
Raquelgarza95
•0
1
投票
6.
答案
159
意见
平均表达与fold change的关系
设计
Aveexpr.
比较
17个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56K•17个月前写的
Lluis里维拉桑丘
▴630
0.
投票
1
回复
229.
意见
DESEQ2组织类型中治疗的比较,忽略其他组织类型
deseq2
比较
设计
配对
治疗
17个月前更新
Swbarnes2.
▴680•17个月前写的
Tinglec.
•0
0.
投票
4.
答案
522.
意见
DESEQ2:将所有TPTS与基线进行比较,并相应地提取结果表
deseq2
对比
设计
18个月前
luciest.rodriguez.
•0
0.
投票
2
答案
192
意见
不同的设计用于通过LIMMA查找DEG
林马
度
设计
19个月前
Amin.Ghareyazi.
•0
0.
投票
8.
答案
338.
意见
两组对照采用RNAseq公式进行DESeq2
deseq2
公式
控制
设计
20个月前更新
迈克尔爱
32K•20个月前写的
窃贼
•0
0.
投票
3.
答案
154
意见
分析策略:两个治疗组在t=0时是否可以采用单纯对照组?
deseq2.
设计
时间课程
基团
21个月前更新
迈克尔爱
32k•写于21个月前
Rob Buurstede.
•0
2
投票
18.
答案
15 k
意见
DESEQ2时间序列设计。
deseq2
timecourse
设计
21个月前更新
西蒙巴尔德温
•0•写入6.5年前
邵
▴90
0.
投票
1
回复
178
意见
DESEQ2多因素RNASEQ实验分析
deseq2
设计
时间课程
22个月前更新
迈克尔爱
32k•写于22个月前
维克多Chano
•0
1
投票
1
回复
221.
意见
在控制批处理效果时,所有与DESeq2的两两比较:参考水平重要吗?
deseq2
差异表达
批量纠正
设计
22个月前更新
迈克尔爱
32k•写于22个月前
wunderl
▴20
0.
投票
1
回复
173
意见
一次执行时间课程RNA SEQ分析,每个时间点都有单一设计或单独的差分分析
deseq2
设计
22个月前更新
迈克尔爱
32k•写于22个月前
adhikb
•0
3.
投票
3.
答案
255.
意见
使用DESeq2在主体模型之间和主体模型内部提取主体效应
deseq2
设计
更新2.0年前
迈克尔爱
32K•2.0年前写的
I.Sudbery.
▴10
3.
投票
5.
答案
399
意见
实验设计RNASEQ差异表达
刨边机
林马
设计
对比
批处理
2.1年前更新
亚伦Lun
写于2.1年前
彼得罗
▴30.
3.
投票
4.
答案
322.
意见
用EdgeR对三种不同情况进行配对分析(肿瘤与正常)
刨边机
设计
矩阵
德
2.1年前更新
亚伦Lun
写于2.1年前
takumima
▴10
0.
投票
7.
答案
492.
意见
DESeq2“设计”参数使用Shiny/rhandsontable的问题
deseq2
闪亮的
设计
rhandsontable
hot_to_r()
2.1年前更新
迈克尔爱
32k•写于2.1年前
hinkel2
•0
0.
投票
1
回复
192
意见
DESeq2 3因素设计-是否拆分数据或添加交互项
deseq2
设计
2.2年前更新
迈克尔爱
32k•写于2.2年前
atongz652
•0
0.
投票
2
答案
268
意见
DESeq2-多因素设计- 3个条件3个时间点
deseq2
设计
2.2年前更新
迈克尔爱
32k•写于2.2年前
BioInfo.
•0
3.
投票
6.
答案
546.
意见
Limma设计/对比度正确?
林马
微阵列
设计
配对
混合模型
2.2年前更新
亚伦Lun
写于2.2年前
Rasmus.agren.
•0
4.
投票
7.
答案
906
意见
Limma时间序列样序模型.Matrix设计设置
林马
设计
model.matrix
时间序列
花样
2.2年前更新
亚伦Lun
写于2.2年前
Tleona3.
•0
1
投票
2
答案
277
意见
不同细胞系和疾病状态的DESeq2设计
deseq2
设计
2.2年前更新
迈克尔爱
32k•写于2.2年前
lu.ne.
•0
0.
投票
7.
答案
556.
意见
DESEQ2核糖体分析:多因素设计
deseq2
设计
timeseries
2.3年前更新的
迈克尔爱
32k•写于2.3年前
Indrik.Wijaya.
▴20
7.
投票
7.
答案
5.6 k
意见
DESeq2似然比试验(LRT)设计- 2个基因型,4个时间点
deseq2
轻轨车
rnaseq.
设计
减少模型
2.4年前更新的
Evocanres.
•0•书面编写4.0年前
I.Castanho
▴50
5.
投票
6.
答案
582.
意见
如何使用Deseq2的样本类型和条件设置适当的分析
deseq2
差异基因表达
设计
两年半前更新的
迈克尔爱
32K•书面写作2.5年前
Newbio17
•0
0.
投票
5.
答案
455.
意见
DESeq2设计公式-与有序变量的相关性
deseq2.
设计
公式
矩阵
2.9年前更新
迈克尔爱
写于2.9年前的
T.Kuilman.
170
2
投票
4.
答案
362.
意见
Limma模型配对和池在一起
林马
设计
rnaseq.
3.0年前更新
Ryan C. Thompson.
7.6k•写于3.0年前
B.Nota.
▴340
0.
投票
5.
答案
464.
意见
DESEQ2使用患者可变性的交互术语是正确的吗?
deseq2
设计
相互作用项
R.
3.1年前
briverog
•0
1
投票
8.
答案
548.
意见
设计与互动术语相似之处和/或差异?
deseq2
Anova.
设计
相互作用项
3.2年前更新
迈克尔爱
3.2年前写的
tarun2.
•0
1
投票
2
答案
703.
意见
DESEQ2 - TCGA未配对RNASEQ数据的设计
deseq2.
设计
,TCGA
不配对
rnaseq.
3.3年前更新
迈克尔爱
3.3年前写的
Talip曾因
▴10
0.
投票
5.
答案
589.
意见
Limma:如何解释双胞胎数据(包括MZ和DZ双胞胎)?
林马
设计
RNA-seq
公式
孪生
3.5年前更新的
亚伦Lun
★26K•3.5年前书写
西蒙斯
•0
3.
投票
7.
答案
800
意见
Deseq2设计公式:如何计算双数据(MZ和DZ)?
deseq2.
孪生
设计
公式
RNA-seq
3.5年前
西蒙斯
•0
2
投票
4.
答案
498.
意见
设计微阵列limma
林马
统计权力
设计
可变性
微阵列
3.5年前更新的
亚伦Lun
★26K•3.5年前书写
roser.navarro
•0
0.
投票
1
回复
975.
意见
采样内部时间序列使用DESEQ2比较
deseq2
时间课程
rnaseq.
设计
对比
4.1年前更新的
迈克尔爱
32K•4.1年前书写
prppmet
•0
2
投票
13.
答案
685.
意见
我应该使用哪个公式来为我的分析设置最好的模型矩阵?
deseq2.
edger.
设计
4.5年前
ZheFrench
▴10
3.
投票
4.
答案
834.
意见
关于控制的WT和突变体之间的DESEQ2 DE
deseq2
多因素设计
设计和对比矩阵
设计
多因素设计
4.6年前
Shimbalama.
•0
61结果•页面
1的2
最近的 ...
答案
答案:.locknamespace()中的'org.hs.eg.db'中的失败
经过
维多利亚
•0
我有同样的问题..没有什么工作......我已经尝试过一切!!
评论:DESEQ问题
经过
dorina.jamniczky.
•0
>表(复制(countdata [,1]))false 1408>头(sort(countdata [,1]))[1]“aagab”“aak1”“aatf”“aabca2”“abca2”“abcc1”“abcc4”我做...
无法加载org.Hs.eg.db
经过
Xulei Huo.
•0
也许,我以为你应该检查你的数据。$ operator因原子向量而无效。
无法加载org.Hs.eg.db
经过
亚历山大
•0
有什么后续报道吗?
答:如何应用Limma-Trend或Voom批量校正单个单元格数据?(非Integ
经过
戈登·斯密
42K.
如果您已经应用了MNNCorrect,则输出已在日志表达式上,因此您将直接输入标准的Limma管道......
投票
答:错误:“org.mm.eg.db”包或命名空间加载失败:
答:错误:“org.mm.eg.db”包或命名空间加载失败:
无法加载org.hs.eg.db.
注释:按照CBIOPortal R-Workshop示例2的说明错误
注释:.onLoad failed in loadNamespace() for 'org.Hs.eg.db'
奖项
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评论员
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亚伦Lun
★26K.
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西班牙,
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