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RNASeq
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69
的观点
我如何建立一个对比矩阵在边缘与makecontrsts,当一个相关的水平下降?
刨边机
RNASeq
更新3天前
戈登•史密斯
42k•写于3天前
瑞安
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47
的观点
Unable to use ensemble bldb's "ensDbFromGff()" function on .gff file from NCBI
ensembldb
RNASeq
4天前•更新3天前
Torkel
•0
3.
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114
的观点
GEO + RNA-seq。完全的新手。
RNASeqData
RNASeq
地理
RNASeqR
帮助
8天前•7天前更新
hgalmoore
•0
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80
的观点
Limma Voom设计和对比矩阵-我的参数也可以是一个因素吗?
RNASeqRData
limma
RNASeq
RNASeqR
9天前由
戈登•史密斯
42k•9天前写的
丽塔
•0
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85
的观点
对于RNAseq样本具有非常不同的计数数的voom-limma工作流
轰
limma
RNASeq
12天前•11天前更新
annadv
•0
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74
的观点
聚类的DEGpatterns和功能分析
DESeq2
RNASeq
DEGreport
更新于25天前
凯文Blighe
2.7k•25天前写的
会
•0
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110
的观点
edgeR -第4.8章时间历程RNAseq实验
刨边机
TimeCourse
RNASeq
更新于24天前
戈登•史密斯
42k•28天前写的
hakusen03
▴10
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45
的观点
如何使用DESeq2以2x2x2实验的形式分析核糖体谱数据
DESeq2
RiboSeq
RNASeq
4周前更新
迈克尔的爱
32k•4周前写的
kyusikkim
•0
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118
的观点
战斗正常化-数据是整数和一些浮动,困惑吗?!
战斗
rnaseq
combatnormalisation
jeffleek
股东价值分析
4周前更新
凯文Blighe
2.7k•写于4周前
zeegzaag
•0
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89
的观点
读取纳米孔Fastq文件
NanoporeRNASeq
RNASeq
5周前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
56k•5周前写的
sinanoori88
•0
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305
的观点
使用edgeR和spike-in来计算绝对丰度
刨边机
SpikeIn
RNASeq
5周前•4周前更新
robert.chen
•0
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103
的观点
问题:为JunctionSeq运行qort时出错
DEXSeq
JunctionSeq
RNAseq
QoRTs
•更新于4周前
n.tear
▴10
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63
的观点
R边的多变量设计矩阵
designmatrix
DifferentialExpression
刨边机
RNAseq
7周前
nageshprabhu.k
▴10
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97
的观点
预处理的问题
股东价值分析
RNASeq
预处理
归一化
BatchEffect
7周前更新
ATpoint
▴570•8周前写的
默罕默德
•0
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41
的观点
环状RNA
CircularRNA
RNASeq
RNAseq123
8周前
rpokhre2
•0
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158
的观点
设置正确的对比。
DESeq2
RNASeq
更新于9周前
swbarnes2
▴670•9周前写的
fcamus
•0
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85
的观点
plotPCA()没有结果
DESeq2
RNASeq
plotpca
更新于9周前
迈克尔的爱
32k•9周前写的
s1760083
•0
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51
的观点
将topGO包的结果保存为一个R对象(rda/rds文件)。
RNASeq
去
topGO
通路
10周前
本
▴20
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142
的观点
DESeq2或EdgeR的设计矩阵
刨边机
DESeq2
RNASeq
更新于11周前
迈克尔的爱
32k•写于12周前
kimmcl860
•0
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77
的观点
使用Deseq2对4组不同的细胞进行RNA-seq分析
DESeq2
RNASeq
12周前更新
ATpoint
▴570•写于12周前
yonatan
•0
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170
的观点
如何从RNAseq数据中去除X和Y染色体基因
DESeq2
RNASeq
3个月前更新
Anubhav
3个月前写的
Archit
•0
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404
的观点
如何椭圆一个子集的数据PCA双标图?
biplot
主成分分析
RNASeq
PCAtools
3个月前更新
凯文Blighe
2.7k•写于3个月前
mschmidt
▴10
3.
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9
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4.4 k
的观点
合并fastq.gz在R?(或在Windows ?)
rnaseq
bioconductor
fastq
4个月前更新
拉斐尔
•0•写于5.7年前
mk.applebee
•0
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111
的观点
DESeq2采用三因素实验设计
DESeq2
RNASeq
4个月前更新
迈克尔的爱
32k•写于4个月前
microPhD
•0
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145
的观点
解决多因素实验中的批量效应问题
刨边机
BatchEffect
RNASeq
4个月前更新
SamGG
▴270•4个月前写的
anikng
•0
0
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2
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106
的观点
“三位一体微分表达式”如何在没有RSEM丰度估计的规范化原始计数工作
三一
DifferentialExpression
RSEM
RNAseq
刨边机
4个月前
harelarik
▴50
0
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1
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114
的观点
执行一个双图从pcaData和coldata在DESeq2,也许PCAtools?
PCAtools
biplot
DESeq2
RNASeq
主成分分析
4个月前更新
凯文Blighe
4个月前写的2.7k•
ecg1g15
•0
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3.
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166
的观点
基因表达与表型的皮尔逊相关性
刨边机
RNASeq
4个月前更新
戈登•史密斯
4个月前写的
weichengz
•0
2
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3.
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186
的观点
样本内基因相关性的归一化
刨边机
归一化
DESeq2
tpm
RNASeq
4个月前更新
戈登•史密斯
4个月前写的
tcalvo
▴40
3.
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One hundred.
的观点
lfcShrink功能用于不同的比较
DESeq2
RNASeq
4个月前
bi.mi
•0
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95
的观点
DESeq2批处理效果
BatchEffect
DESeq2
RNASeq
4个月前更新
迈克尔的爱
32k•5个月前写的
伊戈尔
▴40
0
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4
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140
的观点
30个样本的模型矩阵问题
DESeq2
RNAseq
5个月前
dagurim
•0
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1
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73
的观点
如何提取上二甘醇及其采样值
DESeq2
RNASeq
5个月前更新
凯文Blighe
2.7k•5个月前写的
ecg1g15
•0
0
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2
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148
的观点
为什么count to tpm的值与kallisto的tpm的值不同?
rnaseq
计数
tpm
GenomicFeatures
kallisto
5个月前更新
迈克尔的爱
32k•5个月前写的
m93
•0
2
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3.
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293
的观点
什么长度是用来计算TPM在“散射”包
嘘
calculateTPM
RNAseq
5个月前更新
亚伦Lun
★26k•5个月前写的
Matan G。
▴30
0
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137
的观点
工作:
发育神经生物学和生物信息学博士职位
rnaseq
神经生物学
, tcga
工作
5个月前
劳伦特与
1.4 k
3.
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220
的观点
Affymetrix HT MG-430 PM阵列板AnnotationData package
RNAseq
Affymetrix
鼠标
5个月前更新
圭多Hooiveld
★2.9k•写5个月前
olrema
•0
0
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1
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156
的观点
非原生的GO注释不能成功引入Goseq
goseq
rnaseq
r
6个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
6个月前写的
citronxu
•0
6
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5
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212
的观点
利用RNAseq数据计算少数基因的标准偏差
刨边机
RNAseq
6个月前更新
史蒂夫Lianoglou
13k•写于6个月前
marhabaie
•0
3.
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6
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149
的观点
EdgeR设计矩阵有3个因素
刨边机
全球语言监测机构
RNAseq
6个月前更新
詹姆斯·w·麦克唐纳
6个月前写的
jackiesalzbank
•0
0
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2
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182
的观点
Deseq2 +滤波低计数与噪声eq功能
deseq2
noiseq
lowcounts
rnaseq
7个月前更新
迈克尔的爱
32k•7个月前写的
andreia
•0
1
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7
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137
的观点
如何得到特定条件下的多因素Deseq LRT测试日志P值
Deseq2
轻轨车
因素
RNAseq
7个月前
aishu.jp
▴20
5
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8
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242
的观点
在包含字符列和数字列的数据帧中,只对数字列(多个)进行递减排序
排序
R
RNAseq
字符
数字
7个月前更新
内存
▴60•7个月前写的
camillab。
▴10
0
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2
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198
的观点
EDGER中的CPM函数
刨边机
cpm
rnaseq
7个月前
francesca3
•0
0
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1
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112
的观点
如何描述2个品种的时间序列RNA-seq数据的LRT检测条件
deseq2
轻轨车
RNAseq
条件
8个月前更新
迈克尔的爱
32k•8个月前写的
aishu.jp
▴20
1
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1
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143
的观点
我可以添加复制基因的原始计数吗?
DESeq2
RNAseq
8个月前更新
迈克尔的爱
32k•8个月前写的
尼科莱·伊万诺夫
•0
7
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11
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205
的观点
EdgeR中是否有接近嵌套方差分析的模型?
刨边机
rnaseq
8个月前更新
戈登•史密斯
写于8个月前
deeptiptl74
•0
2
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2
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149
的观点
edgeR批效应校正不均匀分布的组
rnaseq
刨边机
批处理效果
8个月前更新
戈登•史密斯
写于8个月前
rebecca.lea.johnston
•0
0
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1
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120
的观点
StringTie输出作为Ballgown输入
舞会礼服
StringTie
星系
rnaseq
8个月前更新
凯文Blighe
2.7k•8个月前写的
lakshmi9c
•0
0
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0
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105
的观点
有可能在车道内对多个协变量进行归一化吗?
EDASeq
归一化
GC
长度
RNASeq
8个月前
沛富
▴30
1059个结果
1 22
最近……
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点评:Limma实验设计与制作对比
通过
Kesava
•0
谢谢,我不知道这是怎么回事。现在我知道了。
注释:RSamtools idxstats不返回未映射的读取
通过
mja18
▴40
太好了,谢谢马丁!
点评:Limma实验设计与制作对比
通过
凯文Blighe
2.7 k
通过确认:https://www.biostars.org/p/9464603/ 9464603
答:RSamtools idxstats不返回未映射的读取
通过
马丁•摩根
25 k
该特性在Rsamtools 2.7.2中可用。这需要使用R-4.1 / Bioconductor 3.13,并将在接下来的几个d…
用法:复杂因子设计
通过
戈登•史密斯
42 k
edgeR does differential expression for transcripts via catchSalmon function follow the usual edgeR pipeline as you would do for gene…
票
答:RSamtools idxstats不返回未映射的读取
RSamtools idxstats不返回未映射的读取
答案:RSamtools idxstatsBam不能使用远程bam文件
运行>每组100个样本-内存问题
从ensdb . haspens .v86加载基因组文件失败
奖
•所有
老师
来
亚伦Lun
★26 k
学者
来
Herve页面
14 k
学者
来
马丁•摩根
25 k
先知
来
文献董
•0
学者
来
戈登•史密斯
42 k
位置
•所有
沙龙,
27分钟前
Nunoa,
29分钟前
WEHI,墨尔本,澳大利亚,
36分钟前
爱尔兰共和国,
56分钟前
美国,
2个小时前
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