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DESeq
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32.
意见
过滤DESEQ2结果|LFC |> 1基因
rnaseq.
LFC.
DEseq
1天前
ayy2110
•0
1
投票
2
答案
149.
意见
Deseq的标志问题
DESeq
Metagene2.
metagene
更新于10周前
ericfournier2.
▴10•12周前书写
GM.
▴10
0.
投票
3.
答案
181
意见
了解ma绘图失真
deseq2.
MAplot
DESEQ.
11周前更新
迈克尔爱
33K•11周前写的
SP.
•0
0.
投票
5.
答案
271.
意见
Zinb-Wave-Deseq2具有批量数据:选择epsilon值,K和基因数
deseq2.
Zinb.
zinbwave
DESEQ.
3个月前更新
迈克尔爱
33k•写3个月前
Rowyclecamp.
•0
1
投票
12.
答案
2.1K.
意见
Deseq2:在治疗后测试组间差异时,如何调整基线读取计数
deseq2
DESEQ.
7个月前更新
迈克尔爱
33k•6.1年前写的
尼克
•0
1
投票
2
答案
164.
意见
DESEQ错误(NBINOMTEST())
Deseq
nbinomtest.
11个月前
坎菲尔德
▴10
0.
投票
7.
答案
161.
意见
nrow(design) == ncol(object) is not TRUE . nrow(design) == ncol(object) is not TRUE . nrow(design) == ncol(object) is not TRUE
deseq2
DESeq
nrow == ncol不是TRUE
12个月前更新
Kevin Blighe.
3.0k•12个月前写的
Maniermk.
•0
2
投票
3.
答案
154.
意见
安装DESeq时,RCurl包配置失败
错误:包装'rcurl'的配置失败
DESeq
13个月前更新
迈克尔爱
33K•13个月前写的
krunal.24.6
▴10
1
投票
2
答案
122.
意见
用于理解DESEQ2的互动的嘲笑数据
deseq2
DESEQ.
13个月前更新
西蒙和人员
★3.6k•写13个月前
Blawney.
•0
3.
投票
5.
答案
180
意见
如何基于deseq R包对GEO中预处理后的RNA-Seq数据进行过滤和DE分析
DESEQ.
rna-seq
过滤
德
deseq2
14个月前更新
迈克尔爱
33K•14个月前写的
svlachavas
▴780.
1
投票
9.
答案
225.
意见
Deseq的错误结果与DESEQ2进行了一些测试用例吗?
deseq2
DESeq
14个月前更新
西蒙和人员
★3.6k•14个月前写的
megapode32559
•0
0.
投票
7.
答案
223.
意见
如何根据miRNA基因读数分析和找到差异表达基因?
deseq2
DESEQ.
16个月前
husainmanagori1998
•0
0.
投票
1
回复
229.
意见
deseq2计数功能不起作用
deseq2
Deseq
rnaseq.
18个月前更新
迈克尔爱
33k•18个月前写的
MRFOSSL97.
•0
2
投票
3.
答案
281.
意见
DESEQ2 2x2因子设计:找到因子A独有的基因?
deseq2
DESEQ.
差异表达
对比
18个月前更新
迈克尔爱
33k•18个月前写的
基思休赫特
▴130
4.
投票
4.
答案
755.
意见
TMM归一化:DESeqDataSet:分析中的一些值是负的
deseq2
DESEQ.
正常化
22个月前更新
wunderl
▴22•书面书面22个月前
neekonsu
•0
1
投票
2
答案
247.
意见
过滤外来样本会影响DESEQ结果。到底是怎么回事?
DESEQ.
deseq2
22个月前更新
迈克尔爱
33K•22个月前写的
sxv
•0
0.
投票
0.
答案
264.
意见
包括SEQGSEA的SVA导致具有批处理效果的数据
林马
deseq2
SEQGSEA.
SVA.
DESEQ.
22个月前
kentfung
•0
0.
投票
9.
答案
492.
意见
NOOB问题:如何在DESeq2中使用对比进行亚组分析?
DESEQ.
deseq2
对比
亚组
2.3年前
Ariel.
•0
3.
投票
12.
答案
394
意见
为什么我在Deseq中获得Na P值,连续变量?
deseq2
p值
连续的
DESEQ.
2.3年前
Ariel.
•0
2
投票
3.
答案
683.
意见
DESeq2从Cook的阈值中计算异常值替换
deseq2
DESEQ.
rnaseq.
离群值
统计离群值
更新于2.5年前
迈克尔爱
33k•写于2.5年前
Lefeverde.
▴10
0.
投票
1
回复
319.
意见
关于多因素DESEQ分析的问题
DESeq
deseq2
微生物组
肠道微生物组
更新于2.6年前
迈克尔爱
33k•写于2.6年前
费萨尔
•0
0.
投票
3.
答案
428.
意见
运行DESEQ2工作流时奇怪的LFCSHRINK绘图
deseq2.
rnaseq.
rna-seq
deseq2
DESEQ.
2.6年前
班
▴20
0.
投票
7.
答案
1.8K.
意见
deseq2安装问题
DESEQ.
更新于2.6年前
迈克尔爱
33k•写于2.6年前
Bikashten.
•0
4.
投票
7.
答案
1.2K.
意见
DESEQ2设计一个条件超过8个不同的时间点
deseq2
rna-seq
设计矩阵
DESEQ.
更新于2.6年前
迈克尔爱
33k•写于2.6年前
Thindmarsmission.
•0
0.
投票
3.
答案
402.
意见
DESeq2组比较
deseq2
DESEQ.
差异结合分析
2.7年前更新
迈克尔爱
33k•写于2.7年前
rbronste
▴60
3.
投票
5.
答案
473.
意见
帮助多因素DESEQ分析
deseq2
rnaseq.
DESEQ.
2.7年前更新
迈克尔爱
33k•写于2.7年前
MAPK.
•0
0.
投票
7.
答案
462.
意见
DESEQ 2多重比较(3组,24个样本)
DESEQ.
2.7年前更新
迈克尔爱
33k•写于2.7年前
Matthew.Baldwin.
•0
4.
投票
1
回复
12k.
意见
最新版本的R是3.5.1,它与许多生物导体包不兼容。
R.
DESEQ.
tcgabiolinks.
2.8年前
ansari.sarabio
•0
1
投票
5.
答案
395.
意见
组特定条件查询
deseq2
DESEQ.
batcheffect
更新2.8年前
迈克尔爱
33k•书面写作2.8年前
BDY8.
•0
3.
投票
7.
答案
447.
意见
基于LFC的提取拟合值和计算平均值和SE的平均值之间的差异。
deseq2
DESEQ.
2.8年前
blastzone.heimerdinger
•0
0.
投票
8.
答案
664.
意见
多因素、多时间点比较设计公式
rna-seq
deseq2
DESEQ.
R.
更新2.8年前
迈克尔爱
33k•书面写作2.8年前
arun.thilumaran.
•0
0.
投票
1
回复
320.
意见
如何开始规范化
DESEQ.
2.8年前
Raghavaraghava049.
•0
0.
投票
1
回复
334.
意见
在deseq2结果中,基本平均数总是0.5的倍数
DESEQ.
结果
baseMean
2.9年前更新
迈克尔爱
33k•书面写作2.9年前
蝙蝠豆
•0
0.
投票
3.
答案
357.
意见
DEseq - time(3个时间点)和两种治疗的3x2比较
deseq2
DESEQ.
rna-seq
多重比较
2.9年前更新
迈克尔爱
33k•书面写作2.9年前
rbronste
▴60
2
投票
3.
答案
658.
意见
日月光半导体使用DESeq2
deseq2
DESEQ.
正常化
等位基因特异性表达
rnaseq.
3.0年前更新
西蒙和人员
★3.6k•写于3.0年前
c.martinezruiz.
•0
0.
投票
5.
答案
511.
意见
如何使用DESEQ模拟时间课程RNA SEQ数据?
deseq2
R.
makeexampledeseqdataset.
DESEQ.
3.0年前更新
迈克尔爱
33k•3.0年前书写
kjkjindal
•0
3.
投票
7.
答案
893.
意见
新手:使用RNA-SEQ数据构建基因共表达网络
rna-seq
WGCNA
DESEQ.
方法
共同表达
3.1年前更新
Peter Langfelder.
★2.6K•写3.1年前
7 kemzmani
▴10
1
投票
2
答案
528.
意见
DESEQ2复制均值和方差信息
deseq2
DESEQ.
差异分析
蛋白质组学
3.1年前
博尔斯
•0
1
投票
8.
答案
1.2K.
意见
dese2:一种治疗的组特异性效应,同时控制个体效应
deseq2
DESeq
设计和对比矩阵
DESEQ.
3.2年前
spbeginner.
•0
1
投票
3.
答案
528.
意见
DESEQ2样品不平衡
DESEQ.
3.2年前
aishu.jp
▴20
0.
投票
4.
答案
12k.
意见
Deseq的正常化
遗传学
正常化
DESeq
遗传学
正常化
DESeq
3.2年前更新
黛安达
•0•书写10.6年前
瑞罗
▴20
0.
投票
8.
答案
1.4K
意见
比较两种差异表达分析-两种不同的折叠变化
Deseq
deseq2
差异基因表达
rnaseq.
统计测试
3.3年前
码头
•0
0.
投票
4.
答案
538.
意见
当肿瘤样品具有正常组织污染时,标准化计数。
deseq2
DESEQ.
刨边机
rnaseq.
htseqcounts
3.3年前
Deepali.
•0
0.
投票
2
答案
1.8K.
意见
问题加载或运行deseq2
DESEQ.
找不到功能
3.3年前更新
迈克尔爱
33k•写于3.3年前
brynnhvoy
•0
5.
投票
3.
答案
2.1K.
意见
DESEQ2使用SVA的交互
deseq2
SVA.
相互作用项
分组变量
DESEQ.
3.3年前
Kevin.Kingsland
▴40
4.
投票
6.
答案
615.
意见
DESEQ2设计和统计问题
deseq2
差异结合分析
DESEQ.
ATAC-SEQ.
3.3年前更新
迈克尔爱
33k•写于3.3年前
rbronste
▴60
2
投票
10.
答案
984.
意见
DESEQ2结果出口PADJ排序
deseq2
DESEQ.
差异结合分析
更新于3.4年前
迈克尔爱
33k•3.4年前书写
rbronste
▴60
2
投票
4.
答案
687.
意见
矩阵不是全秩 - DESEQ2
deseq2
模型矩阵不是全级别
model.matrix
DESEQ.
差异结合分析
更新于3.4年前
西蒙和人员
★3.6k•3.4年前书写
rbronste
▴60
2
投票
5.
答案
572.
意见
将DESeq2输出映射回染色体位置
deseq2
DESEQ.
diffbind
差异结合分析
更新于3.4年前
迈克尔爱
33k•3.4年前书写
rbronste
▴60
40
投票
44.
答案
5.7 k
意见
已公布的RNA SEQ数据在计算P值和FDR时经常分析错误?
罗斯福
p值
DESeq
RNA-SEQ.
更新于3.5年前
韦德戴维斯
▴60•书面书写4.0年前
yjiangnan
▴10
50个结果•页面
1的1
最近的 ...
答案
注释:无法复制“读取到区域”CSAW教程的片段长度
经过
亚伦Lun
★26K.
在进一步的分析中,在较低的距离上的峰值是否提出了一个问题。不。这只是一个幻峰,看EN…
评论:使用DESEQ2分析纳米纳斯数据吗?
经过
迈克尔爱
33K.
如上所述,不推荐用于DESEQ2(或EDGER)的预定化数据。软件的一部分是考虑到preci ...
评论:使用DESEQ2分析纳米纳斯数据吗?
经过
xiaofeiwang18266
▴20
利用内源性内务管理基因>来估计RUV因子,并在设计公式中使用这些。按照下面的规则,对吧?在…
评论:使用DESEQ2分析纳米纳斯数据吗?
经过
xiaofeiwang18266
▴20
Hi @mikelove,如果我想使用nSolver归一化,我想再次检查DESeq2的输入。我从“sabry_analysis”中看到。R " https://g..。
答:Tximport / Deseq2归一化过程
经过
迈克尔爱
33K.
是否所有样本均以相同的参考资料(例如相同的鲑鱼指数)进行量化?通常,你会让tximport和DESeq2…
投票
TCGA数据的相关分析
评论:包裹“”
答:MicroRNA数据的edger
答:MicroRNA数据的edger
答:MicroRNA数据上的Edger
奖项
• 全部
学者
至
詹姆斯·w·麦克唐纳
57K.
受欢迎的问题
至
Ahdee.
▴50
受欢迎的问题
至
文森特J. Carey,Jr.
6.4 k
受欢迎的问题
至
Jon看看
▴180.
受欢迎的问题
至
戈登·斯密
43K.
位置
• 全部
诺华生物医学研究机构,
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法国,
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