控制=因子（c（rep（“控制”，5），Na，na））影响=因子（c（rep（rep（“受影响”，7））））库（deseq2）dds <-deseqdatasetFrommatrix（countdata = Counttable，Design，Design，Design，Design=〜控制+受影响的，coldata = data.frame（控制=控制，受影响=受影响））normcounts <-rlog（dds，blind = false）

这个错误来了

DESEQDATASETFROMMATRIX中的错误（countdata = Counttable，design =〜控制 +：ncol（countdata）== nrow（coldata）是不正确的

你好，

正如错误消息所暗示的那样，要使此命令正常工作，以下内容必须返回true：

meta < -  data.frame（控制=控制，受影响=受影响）ncol（counttable）== nrow（meta）

也就是说，输入原始计数表的列数（传递给该函数为Countdata）必须等于输入样本元数据的行数（以酷塔）。还可以得出结论，这些顺序（列和行）必须匹配。

作为一个建议，我认为您可能需要：

dds <-deseqdatasetFrommatrix（countdata = counttable，design =〜条件，coldata = data.frame（条件= c（控制，影响）））

，假设C（控制，受影响）是完美与可计数

凯文