包 |
版本 |
标题 |
acgh. |
1.4.1 |
阵列比较基因组杂交数据的类和函数。 |
affxparser |
1.2.0 |
Affymetrix文件解析SDK |
affy |
1.8.1. |
Affymetrix寡核苷酸阵列的方法 |
Affycomp. |
1.6.0 |
图形工具箱,用于评估Affymetrix表达措施 |
affydata |
1.6.0 |
Affymetrix数据用于演示 |
affylmGUI |
1.4.0 |
利用Limma包的辅助分析GUI |
Affypdnn. |
1.4.0 |
affy包的探针依赖近邻(PDNN) |
affyplm. |
1.6.0 |
拟合探测级模型的方法 |
affyqcreport. |
1.8.0. |
QC报告Affybatch对象的生成 |
altcdfenvs |
1.4.0 |
替代cdfenvs |
andaffy. |
1.2.0 |
Affymetrix生物元数据的注释工具 |
AnnBuilder |
1.8.0. |
Biocucton Annotation数据包构建器 |
注释 |
1.8.0. |
微阵列注释 |
apComplex |
1.4.0 |
使用AP-MS蛋白质数据估算蛋白质复杂成员资格 |
arraymagic. |
1.8.0. |
双色cDNA阵列质量控制和预处理 |
ressquality. |
1.4.0 |
在斑点阵列上评估阵列质量 |
b |
1.2.0 |
贝叶斯间隔映射诊断 |
Biobase |
1.8.0. |
BioBase:生物导体的基础功能 |
bioDist |
1.2.0 |
不同的距离措施 |
生物雕 |
1.4.0 |
与生物艺术数据库的接口(例如ensemble bl) |
Biostrings |
1.4.0 |
串对象重新陈述生物序列 |
桥 |
1.2.0 |
差异基因表达的贝叶斯鲁棒推论 |
类别 |
1.2.0 |
类别分析 |
ChromoViz |
1.2.0 |
基因表达数据的多峰可视化 |
Clusterstab. |
1.2.0 |
计算微阵列数据的集群稳定性分数 |
椰子 |
1.2.0 |
基于共引的不同检验统计。 |
兑换 |
1.4.0 |
转换微阵列数据对象 |
CTC. |
1.4.0 |
群集和树转换。 |
达马 |
1.2.0 |
有效的双色微阵列数据设计与分析 |
ded |
1.2.2 |
微阵列数据的距离摘要差分表达 |
diffGeneAnalysis |
1.12.0 |
进行差异基因表达分析 |
dnacopy. |
1.4.0 |
DNA拷贝数数据分析 |
Dyndoc. |
1.8.0. |
动态文档工具 |
ebarrays. |
1.2.0 |
微阵列的经验贝叶斯 |
ecolitk |
1.2.0 |
Meta-Data和E. Coli的工具 |
edd |
1.8.0. |
表达密度诊断 |
ExtentSvector. |
1.2.0 |
导航r的对象与外部存储 |
factdesign. |
1.4.0 |
析因设计微阵列实验分析 |
FDRAME. |
1.2.0 |
微阵列实验的FDR调整(FDR-AME) |
gcrma. |
2.2.1 |
使用序列信息的背景调整 |
基因糖 |
1.6.0 |
微阵列分析工具 |
Genefilter. |
1.8.0. |
genefilter:筛选基因 |
GeneMeta |
1.2.0 |
高通量实验的荟萃分析 |
geneplotter |
1.8.0. |
生物体的葡萄相关功能 |
总的来说 |
1.4.2 |
基因和序列分析 |
GenereCommender. |
1.2.0 |
一种基因推荐算法,用于识别与基因查询组共同的基因 |
GeneSpring |
2.2.0 |
Genespring R集成功能 |
基因克拉克 |
1.2.0 |
基因克拉克集成功能 |
遗传赛 |
2.8.0 |
微阵列时间序列和网络分析 |
gff3plotter. |
1.4.0 |
基因组布局实验数据的绘制 |
很高兴 |
1.2.0 |
DNA的得失分析 |
Globalancova |
1.4.0 |
计算组间差异基因表达的全局测试 |
全球化境 |
3.2.0 |
检测一组基因与临床变量的相关性 |
Gocluster. |
1.4.0 |
结合注释数据分析聚类结果。 |
GOstats |
1.4.0 |
用于操作GO和微阵列的工具。 |
gools |
1.2.0 |
基因本体数据库的功能 |
GPLS. |
1.2.0 |
使用广义偏最小二乘的分类 |
图形 |
1.8.0. |
图:要处理图形数据结构的包 |
graphar. |
1.2.0 |
图论联想测验 |
缝 |
1.2.0 |
多种条件下鉴别差异表达基因的异质误差模型 |
六己 |
1.4.0 |
六角形融合惯例 |
霍波哈 |
1.4.0 |
层次有序划分与折叠混合(HOPACH) |
超图 |
1.2.0 |
提供超图数据结构的包装 |
Icens |
1.2.0 |
NPMLE用于审查和截断的数据 |
表意文字 |
1.4.0 |
表意文字 |
嫁祸于 |
1.2.0 |
impute:微阵列数据的Imputation |
溜溜溜 |
1.2.0 |
联系情节 |
keggsoap. |
1.4.0 |
客户端SOAP访问KEGG |
林马 |
2.2.0 |
微阵列数据的线性模型 |
limmaGUI |
1.6.0 |
GUI的limma软件包 |
简述 |
1.4.0 |
使用本地池误差(LPE)方法分析微阵列数据的方法 |
maanova |
1.0.0 |
分析微阵列实验的工具 |
macat |
1.4.0 |
微阵列染色体分析工具 |
Madb. |
1.2.0 |
微阵列数据库和实用功能用于微阵列分析。 |
made4 |
1.4.0 |
使用ADE4多变量分析微阵列数据 |
makecdfenv |
1.8.0. |
CDF环境制造商 |
庄园 |
1.2.0 |
微阵列正常化 |
marray |
1.8.0. |
双色斑点微阵列数据的探索性分析 |
maSigPro |
1.2.0 |
在时间阵列微阵列数据中的显着基因表达谱不同 |
matchprobes |
1.2.1 |
阵列上探针序列匹配的工具 |
MCRestimate |
1.4.0 |
错误分类错误估计与交叉验证 |
MeasurementError.Cor. |
1.2.0 |
相关系数的测量误差模型估计 |
MergeMaid |
2.2.0 |
合并女仆 |
MIPP. |
1.2.0 |
错误分类惩罚后验分类 |
ml interfaces |
1.2.1 |
统一的界面到R机器学习程序,用于生物导体容器中的数据 |
mmgmos. |
1.2.0 |
寡核苷酸信号的多芯片改性γ模型 |
msbase |
1.4.0 |
质谱大众清单操纵的基本类和方法。 |
乘 |
1.8.0. |
基于重采样的多假设检测 |
nnnorm. |
1.4.0 |
基于强大神经网络的CDNA微阵列数据的空间和强度基于CDNA微阵列数据 |
奥林 |
1.6.0 |
优化双色微阵列的局部强度依赖性标准化 |
olingui. |
1.4.0 |
olin的图形用户界面 |
ontoTools |
1.6.0 |
用于使用本体的图和稀疏矩阵;用于源头管理的命名法的正式对象 |
Birseqsim |
1.4.0 |
成对序列对准相似性简单。 |
pamr |
1.28.0. |
微阵列的预测分析 |
pdmclass. |
1.2.0 |
使用惩罚判别方法进行微阵列样品的分类 |
pgUtils |
1.2.0 |
PostgreSQL数据库的实用程序函数 |
pickgene |
1.2.0 |
微阵列表达数据分析的自适应基因拣选 |
plgem |
1.2.0 |
权力法全球错误模型 |
pl |
1.2.0 |
实现Affymetrix PLIER算法 |
普拉达 |
1.6.3 |
基于细胞功能测定的数据分析 |
过程 |
1.6.3 |
密度密度加工 |
qvalue. |
1.4.0 |
错误发现率控制的q值估计 |
拉玛 |
1.2.0 |
微阵列的稳健分析 |
Rankprod. |
1.2.0 |
鉴别差异表达基因的秩积法。 |
RBGL |
1.6.0 |
测试界面来提升C ++图形lib |
RDBI. |
1.4.0 |
通用数据库方法 |
rdbipgsql. |
1.4.0 |
PostgreSQL访问 |
雷培 |
1.2.0 |
区域表达偏见 |
redostools. |
1.8.0. |
用于R的存储库工具 |
Resourcerer |
1.4.0 |
从TIGR Resourcerer读取注释数据或将注释数据转换为Bioconductor数据包。 |
RFCDMIN. |
1.2.0 |
RFLOFCYT示例的最小数据库 |
Rflowcyt. |
1.2.0 |
用于流式细胞仪分析的统计工具和数据结构 |
Rgraphviz |
1.8.0. |
为R图形对象提供绘图功能 |
rhdf5 |
1.6.0 |
R的HDF5接口 |
RMAGEML |
测试盒框 |
处理Mageml文件 |
中华民国 |
1.4.0 |
ROC的公用事业,Uarray焦点 |
RSNPper |
1.2.0 |
interface to chip.org::SNPper for snp相关数据 |
Ruuid |
1.8.0. |
Ruuid:提供普遍唯一的ID值 |
安全 |
1.2.0 |
功能与表达的意义分析 |
SAGElyzer |
1.8.0. |
处理Sage库的包 |
Sagenhaft. |
1.2.0 |
读取和比较SAGE库的函数集合 |
SBMLR |
1.24.0 |
SBML-R接口和分析工具 |
siggenes |
1.4.0 |
SAM和Efron的经验贝叶斯方法 |
simpleaff. |
2.4.2 |
非常简单的Affymetrix数据高级分析 |
simulatorapms. |
1.2.1 |
计算地模拟AP-MS技术。 |
SNAData |
1.4.0 |
社交网络分析数据示例 |
剪接 |
1.2.0 |
剪接 |
SpoteDiftation |
1.2.0 |
微阵列点分割和网格用于微阵列斑点 |
SSIZE. |
1.2.0 |
估计微arry样品尺寸 |
斯坦 |
1.2.0 |
微阵列数据的结构分析 |
stepNorm |
1.2.0 |
cDNA微阵列的逐步归一化功能 |
tilingArray |
1.2.0 |
平铺阵列的分析 |
timecourse |
1.2.0 |
开发芯片时间历程数据的统计分析 |
TKWidgets. |
1.8.0. |
基于RK小部件 |
暮 |
1.4.0 |
局部错误发现率的估计 |
vsn |
1.8.0. |
微阵列数据的方差稳定和校准 |
webbioc |
1.2.0 |
Bioconductor Web界面 |
widgetInvoke |
1.2.0 |
函数的评估小部件 |
widgetTools |
1.6.0 |
创建一个交互式tcltk小部件 |
xcms |
1.2.0 |
LC / MS和GC / MS数据分析 |