包:biomaRt
描述:该软件包提供了R中的API来查询BioMart数据库，例如Ensembl (http://www.ensembl.org)，这是一个生成和维护后生动物基因组自动注释的软件系统。目前实现了两组函数。第一套功能旨在模仿其他生物艺术API的功能，如Martshell, Martview等(参见http://www.biomart.org了解更多信息)。这些功能非常通用，可以与任何BioMart系统一起使用。它们允许检索其他生物艺术API提供的所有信息。第二组函数是为Ensembl量身定制的，是微阵列数据分析中常用的一组查询。使用这两组函数，例如，可以从affy id's、locuslink、RefSeq、entrezgene、..等标识符开始，用最新的注释注释数组上的特性。标注包括基因名称、GO、OMIM标注等。该包还提供了在Ensembl中所有物种的这些标识符之间的同源映射。基因可以预先选择，以满足一定的要求，例如，提供已知与糖尿病有关的所有人类基因的筛选。在此基础上，biomaRt使您能够从R的biomaRt数据库中检索任何类型的可用信息。
版本:1.4.0
作者:史蒂芬Durinck
——沃尔夫冈·胡贝尔
——肖恩·戴维斯
维护人员:史蒂芬Durinck
依赖关系:方法，RMySQL, XML
建议:没有一个
SystemRequirements:没有一个
许可:LGPL版本
URL:http://www.esat.kuleuven.ac.be/~sdurinck
功能描述
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