| 包 | 维护人员 | 标题 |
|---|---|---|
| adSplit | 克劳迪奥·Lottaz | 注解驱动的集群 |
| affylmGUI | 基斯Satterley | 使用limma包进行affy分析的GUI |
| BeadExplorer | 加雷斯·维奇 | Illumina BeadChip数据的QC、标准化、注释和探索 |
| 荡妇 | Brian S. Yandell | 贝叶斯区间映射诊断 |
| Biobase | Biocore团队 | Biobase: Bioconductor的基函数 |
| bioDist | Biocore团队 | 不同的距离测量 |
| 桥 | 拉斐尔Gottardo | 差异基因表达的贝叶斯鲁棒推理 |
| 类别 | 美国猎鹰 | 类别分析 |
| clusterStab | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 计算微阵列数据的集群稳定性分数 |
| CoCiteStats | r .绅士 | 基于共引的不同测试统计。 |
| 国王杯 | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 执行癌症异常值分析的功能。 |
| ctc | 安东尼·卢卡斯 | 集群和树转换。 |
| daMA | Jobst Landgrebe | 阶乘双色微阵列数据的高效设计与分析 |
| DEDS | 肖渊源 | 微阵列数据的距离汇总差分表达式 |
| diffGeneAnalysis | Choudary Jagarlamudi | 执行差异基因表达分析 |
| EBarrays | Deepayan Sarkar | 微阵列的经验贝叶斯 |
| edd | 文斯凯里 | 表达密度诊断 |
| factDesign | 丹尼斯Scholtens | 析因设计微阵列实验分析 |
| fdrame | 有效率切尼克斯贝格 | 微阵列实验FDR调整(FDR- ame) |
| genefilter | Biocore团队 | 基因过滤器:从微阵列实验中过滤基因的方法 |
| GeneMeta | Biocore团队 | 高通量实验的元分析 |
| geneRecommender | 格雷格已经 | 一种基因推荐算法，用于识别与查询集基因共表达的基因 |
| 麝猫 | Korbinian Strimmer | 微阵列时间序列与网络分析 |
| GlobalAncova | r·迈斯特 | 计算组间差异基因表达的全局测试 |
| globaltest | Jelle Goeman | 检测具有临床变量的基因组的关联 |
| GOstats | 美国猎鹰 | 用于操作GO和微阵列的工具。 |
| gpl | Biocore团队 | 广义偏最小二乘分类 |
| GraphAT | 托马斯LaFramboise | 图论关联测验 |
| 哼哼 | HyungJun曹 | 多条件下差异表达基因鉴别的异构误差模型 |
| hopach | 凯瑟琳·s·波拉德 | 分层有序分区和折叠混合(HOPACH) |
| Icens | Biocore团队 | 删减和截断数据的NPMLE |
| 嫁祸于 | Balasubramanian纳史木汗 | impute:微阵列数据的impute |
| lapmix | Yann Ruffieux | 微阵列实验中的拉普拉斯混合模型 |
| limma | 戈登•史密斯 | 微阵列数据的线性模型 |
| limmaGUI | 基斯Satterley | 用于limma包的GUI |
| LMGene | 李根哲 | 用于基因表达阵列中差异表达基因的数据转换和鉴定的LMGene软件 |
| logicFS | Holger Schwender | SNP相互作用的鉴定 |
| 简述 | Nitin耆那教徒的 | 微阵列数据的局部合并误差分析方法 |
| maanova | Lei吴 | 分析微阵列实验的工具 |
| macat | Joern Toedling | 微阵列染色体分析工具 |
| made4 | Aedin Culhane | 利用ADE4对微阵列数据进行多元分析 |
| MantelCorr | 布莱恩Steinmeyer | 计算壁炉架集群相关性 |
| maSigPro | 安娜Conesa | 时间过程微阵列数据中基因表达谱的显著差异 |
| MCRestimate | 马库斯Ruschhaupt | 交叉验证的错误分类误差估计 |
| MeasurementError.cor | 坞城叮 | 相关系数的测量误差模型估计 |
| MergeMaid | 于宁波钟 | 合并女仆 |
| metaArray | 遭受崔 | 集成微阵列数据进行元分析 |
| Mfuzz | 马提亚Futschik | 时间序列基因表达数据的软聚类 |
| MLInterfaces | 诉凯利 | 生物导体容器中数据的R机器学习过程的统一接口 |
| 乘 | 凯瑟琳·s·波拉德 | 基于重采样的多重假设检验 |
| nem | Florian Markowetz | 嵌套效应模型来重建表型层次结构 |
| 推动 | n .院长 | 正态均匀差分基因表达检测 |
| OCplus | 亚历山大plone ( | 微阵列实验的操作特性、样本量和局部fdr |
| OrderedList | 克劳迪奥·Lottaz | 有序基因表的相似性 |
| pairseqsim | 维特尔Wolski | 成对序列比对相似性简单。 |
| pamr | Rob TIbshirani | 微阵列预测分析 |
| pcaMethods | Wolfram Stacklies | PCA方法的集合。 |
| pcot2 | 莎拉的歌 | 原理坐标和霍特林t平方法 |
| pdmclass | 詹姆斯·w·麦克唐纳 | 基于惩罚判别法的微阵列样品分类 |
| pickgene | Brian S. Yandell | 微阵列表达数据分析的自适应基因选择 |
| plgem | 马狄亚 | 幂律全局误差模型 |
| qvalue | 约翰·d·斯托里 | 错误发现率控制的q值估计 |
| RankProd | Fangxin香港 | 鉴别差异表达基因的秩积法及其在元分析中的应用 |
| rflowcyt | 勒默尔 | 流式细胞分析的统计工具和数据结构 |
| 中华民国 | 文斯凯里 | ROC的实用程序，以uarray为焦点 |
| 安全 | 威廉·t·巴里 | 功能与表达的显著性分析 |
| SAGx | 每Broberg | 基因芯片的统计分析 |
| siggenes | Holger Schwender | SAM和Efron的经验贝叶斯方法 |
| sigPathway | Weil赖 | 路径分析 |
| simpleaffy | Crispin米勒 | 非常简单的Affymetrix数据的高级分析 |
| sizepower | Weiliang邱 | 微阵列研究中的样本容量和功率计算 |
| sscore | 理查德•肯尼迪 | Affymetrix寡核苷酸微阵列的S-Score算法 |
| ssize | 格雷戈里·r·沃恩斯 | 估计微阵列样本量 |
| 斯塔姆 | 克劳迪奥·Lottaz | 微阵列数据的结构化分析 |
| timecourse | 御川台 | 发育微阵列时间过程数据的统计分析 |
| 《暮光之城》 | 斯蒂芬妮Scheid | 估计局部错误发现率 |
| webbioc | 科林·a·史密斯 | Bioconductor Web界面 |