基因组数据
1296软件包;还…
包裹'着陆页'
x < - rnorm(1000)y < - x + rnorm(1000)df < - data.frame(x = x,y = y)图(y〜x,df)fit < - lm(y〜x,df)ANOVA(适合)
##差异分析表## ##响应:Y ## DF SUM SQ平均SQ F值Pr(> F)## x 1 999.71 999.71 929.56 <2.2E-16 *** ## Residuals 998 1073.32 1.08 ##--- ## signif。代码:0'***'0.001'**'0.01'*'0.05'。'0.1''1
abline(适合)
data.frame()
阴谋()
那lm()
那Anova()
那abline()
:方法定义了仿制改变实例
发现和帮助
类(拟合)方法(class = class(fit))方法(plot)?“plot”?“plot.formula”
标签完成!
示例:使用DNA序列
图书馆(Biostrings)DNA < - dnastringset(C(“AACAT”,“GGCGCCT”))逆转录(DNA)
##长度2 ##宽度SEQ ## [1] 5 ATGTT ## [2] 7 AGGCGCC
数据(phix174phage)phix174phage
长度为6的##甲DNAStringSet实例##宽度SEQ名称## [1] 5386 GAGTTTTATCGCTTCCATGACG ... GATTGGCGTATCCAACCTGCA Genbank登录## [2] 5386个GAGTTTTATCGCTTCCATGACG ... GATTGGCGTATCCAACCTGCA RF70s ## [3] 5386 GAGTTTTATCGCTTCCATGACG ... GATTGGCGTATCCAACCTGCA SS78##[4] 5386 gagttttatcgcttccatgacg ... gattggcgtatccaacctgca bull ## [5] 5386 gagttttatcgcttccatgacg ... gattggcgtatccaacctgca g97 ## [6] 5386 gagttttatcgcttccatgacg ... gattggcgtatccaacctgca neb03
Letterfrequency(phix174phage,“gc”,as.prob = true)
## g | c ## [1,] 0.4476420 ## [2,] 0.4472707 ## [3,] 0.4472707 ## [4,] 0.4470850 ## [5,] 0.4472707 ## [6,] 0.4470850
发现和帮助
课程(DNA)?“Dnastringset-class”?“逆转,dnastringset-方法”
步骤1.实验设计
步骤2.湿式实验室序列制剂
步骤3.(Illumina)测序