用生物导体协调单细胞分析
作者:Robert Amezquita [Aut],Aaron Lun [Aut,Cre],Stephanie Hicks [Aut],Raphael Gottardo [Aut]
版本:1.0.6
修改的:2020-11-13
编译:2021-03-24
环境:R版本4.0.4(2021-02-15),Biocumon 3.12
执照:cc by-nc-nd 3.0我们
版权:Bioconductor,2020
来源:https://github.com/biococtor/orchestratingsinglecellanalysis
欢迎
这是网站“用生物导体协调单细胞分析”是一本教授用户一些常见工作流程用于分析单细胞RNA-SEQ数据(SCRNA-SEQ)的书。本书将教您如何利用尖端生物导体工具来处理,分析,可视化和探索SCRNA-SEQ数据。此外,它可以作为稿件的在线伴侣“用生物导体协调单细胞分析”。
虽然我们专注于SCRNA-SEQ数据,但在整个细胞层面,在整个本书中使用的许多工具,公约和分析策略都会广泛适用于其他类型的测定的较新技术。通过学习Biocumon的语法,我们希望为您提供探索自己的数据的起点,无论是ScrNA-SEQ还是其他方式。
本书组织成三部分。在里面前言,我们介绍了这本书,并潜入学习R和Biocomiond(初学者和开发人员级别)的资源。第一部分以关键数据基础架构的教程结尾,SinglecellexPeriment.类,用于整个生物导体的单细胞分析和随后的部分。
第二部分,焦点主题,首先概述框架进行分析SCRNA-SEQ数据,在每个后续章节中介绍了更深入的潜水。
第三部分,工作流程,主要提供在整个书中分析各个数据集的代码。
最后,附录突出我们的贡献者。
如果您想引用这项工作,请使用参考“用生物导体协调单细胞分析”。
这本书是写的RAMAMAMDOW.和抄写。OSCA是一种协作努力,由来自生物群体团队的各种人士提供贡献工作流,修复和改进的各种人士。
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