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Bioconductor://www.andersvercelli.com
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BioC 2019:软件和生物学连接的地方

时间:2019年6月24日- 27日
活动:开发者日,主要会议,研讨会
地点:纽约大学和洛克菲勒大学纽约,美国
松:Bioconductor团队(# bioc2019频道)
Twitter:# bioc2019

BioC2019强调当前的发展内外Bioconductor项目。它包括:

确认扬声器

Rob Patro石溪大学

我是石溪大学计算机科学系的助理教授。我的主要学术兴趣包括计算生物学和生物信息学、机器学习、编程语言、计算机图形学、科学可视化和并行计算。我对数学、物理、音乐、政治和电子游戏也有兴趣。

Jeffrey韭菜约翰霍普金斯大学

Leek博士领导着一群研究人员、教育工作者和数据科学家,他们利用数据解决分子生物学、人类健康、元研究、教育和其他任何他们认为对世界有用的问题。它们生成的数据工具和代码也可以用于您的项目。

埃利- Papaemmanuil纪念斯隆凯特琳癌症中心(Memorial Sloan Kettering Cancer Center

Papaemmanuil实验室是一个临床、计算、分子和数学研究人员的集体,有兴趣研究获得性突变在癌症发展中的作用,以及这些如何决定临床表型和对治疗的反应。她的任务是执行研究,使肿瘤临床实践向前发展。

Simina博卡乔治敦大学

Boca博士分析组学数据,包括代谢组学和基因组学,并考虑它们在精准医学中的下游应用。特别是,她为高维数据分析开发了新颖的计算和统计方法,领导了第一个全面的杜氏肌营养不良代谢组学研究,并参与了多个人类肿瘤的早期外显子组测序项目。其他感兴趣的领域包括癌症流行病学和人群遗传学。

列文克莱门特比利时根特大学。

克莱门特小组开发了新的统计方法和工具的解释组学数据。他们的研究基于三个组学领域:元基因组学、转录组学(RNA-seq和单细胞RNA-seq)和蛋白质组学(基于定量蛋白质组的质谱鉴别和差异分析)。他们还利用组学实验设计和数据分析方面的专业知识为生命科学研究人员提供服务,并对“组学数据集成”有着浓厚的兴趣。

利华国际朱莉朱马萨诸塞州大学

他的兴趣是通过挖掘和整合ChIP-seq, RNA-seq, ATAC-seq, miRNA-seq, Hi-C, shRNA-seq, PAS-seq, nadi -seq and guidei -seq等高通量数据集,了解基因调控和癌症病因学,生物标志物发现,以及基因组编辑技术的开发和应用。她的专长是算法和计算工具开发,她的团队是Bioconductor项目的积极贡献者。她开发了十几个包含各种实用工具的包,包括机器学习、峰值调用、motif识别和对齐、ATACseq数据质量评估、注释、数据集成、可视化、gRNA设计和CRISPR基因组编辑研究中的全基因组脱靶识别。

Anshul Kundaje斯坦福大学,

Anshul Kundaje是斯坦福大学遗传学和计算机科学的助理教授。他的主要研究领域是大规模计算调控基因组学。Kundaje实验室专门为大规模开发统计和机器学习方法综合分析异构、高通量功能基因组和基因数据解读监管元素和远程监管互动,学习监管网络模型在预测个体、细胞类型和种类,提高检测和解释自然和疾病相关的遗传变异。

更多信息:workshop@bioconductor.org