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回答:如何使用plotCounts()与单个对比来绘制基因计数?
通过
swbarnes2
▴710
如果我没记错的话,plotCounts制作了一个简单的数据帧,其中包含您请求的基因的表达式值,以及colData…
评论:Limma配对分析设计问题
通过
jefflincoln4
•0
谢谢你戈登。还有一件事,为什么要用血铁浓度的对数?
答:Limma配对分析设计问题
通过
戈登•史密斯
42 k
只要把血铁浓度和“配对”放在设计矩阵中。Limma将自动处理差异——没有必要……
注释:提取findPalindrome()结果
通过
Herve页面
14 k
此外,你有一点:' Biostrings::findPalindromes() '的输出是一个XStringViews对象和' as.data.frame() '做了一个糟糕的工作在th…
注释:使用我自己的R版本4.0.2的数据库计算fgsea
通过
assaron
▴190
我不确定在你的情况下什么是最好的行动方案,如果有的话,但我建议保持基因的排名-…
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评论:DESeq2组内变异性大范围
评论:差异基因表达分析存在的问题
评论:dese2中的正常化
答:用我自己的R版本4.0.2的数据库计算fgsea
注释:lmFit,蛋白质数量
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