BioConductor软件包- 1.6发布

包裹 版本 标题
acgh. 1.1.7 阵列比较基因组杂交数据的类和函数。
affy 1.6.7 Affymetrix寡核苷酸阵列的方法
Affycomp. 3 图形工具箱,用于评估Affymetrix表达措施
affydata 1.4.1 Affymetrix数据用于演示
聘请圭圭 1.2.7 利用Limma包的辅助分析GUI
Affypdnn. 1.1.0 affy包的探针依赖近邻(PDNN)
affyplm. 1.3.3. 拟合探测级模型的方法
altcdfenvs. 1.1.11 替代CDFenvs.
andaffy. 1.0.18 Affymetrix生物元数据的注释工具
annbuilder 1.5.31 Biocucton Annotation数据包构建器
注释 1.5.16 微阵列注释
apComplex 1.1.5 使用AP-MS蛋白质数据估算蛋白质复杂成员资格
arraymagic. 1.5.8 双色cDNA阵列质量控制和预处理
ressquality. 1.0.11 在斑点阵列上评估阵列质量
b 1.0.3 贝叶斯间隔映射诊断
Biobase 1.5.12 BioBase:生物导体的基础功能
生物派 1.0.0 不同的距离措施
生物雕 1.0.4 与生物艺术数据库的接口(例如ensemble bl)
Biostrings 1.1.1 串对象重新陈述生物序列
1.0.1 差异基因表达的贝叶斯鲁棒推论
类别 1.0.1 类别分析
ChromoViz 1.0 基因表达的多模式可视化
椰子 1.0.0 基于共引的不同检验统计。
兑换 1.1.11 转换微阵列数据对象
CTC. 1.2.7 群集和树转换。
达马 1.0.1 有效的双色微阵列数据设计与分析
ded 1.0.5 微阵列数据的距离摘要差分表达
dnacopy. 1.1.2 DNA拷贝数数据分析
Dyndoc. 1.5.5 动态文档工具
ebarrays. 1.0.19 微阵列的经验贝叶斯
ecolitk 1.0.1 Meta-Data和E. Coli的工具
edd 1.5.1 表达密度诊断
factdesign. 1.1.5 阶乘设计的微阵列实验分析
Gcrma. 1.1.4 使用序列信息的背景调整
基因糖 1.3.2 微阵列分析工具
Genefilter. 1.6.3 genefilter:筛选基因
GeneMeta 1.0.0 高吞吐量实验的元分析
geneplotter 1.6.1 生物体的葡萄相关功能
GenereCommender. 1.0.2 一种基因推荐算法,用于识别与基因查询组共同的基因
Genespring. 2.0.0 Genespring R集成功能
基因克拉克 1.0.6 基因克拉克集成功能
遗传赛 2.4.1 微阵列时间序列和网络分析
gff3plotter. 1.0.2 构造和绘制GFF3数据文件
很高兴 1.0.4 DNA的得失分析
全球化境 3.0.5. 检测一组基因与临床变量的相关性
Gocluster. 1.0.3 结合注释数据分析聚类结果。
GOstats 1.1.3 用于操纵Go和微阵列的工具。
gools 1.0.6 基因本体数据库的功能
GPLS. 1.0.6 使用广义偏最小二乘的分类
图形 1.5.9 图:要处理图形数据结构的包
graphar. 1.0.0 图论联想测验
六己 1.2.7 六角形融合惯例
霍波哈 1.1.1 层次有序划分与折叠混合(HOPACH)
超图 1.0.0 提供超图数据结构的包装
1.0.0 NPMLE用于审查和截断的数据
表意文字 1.0.1 表意文字
赋予 1.0.2 赋予:微阵列数据的估算
溜溜溜 1.0.8 联系情节
keggsoap. 1.1.5 客户端SOAP访问KEGG
林马 1.9.6 微阵列数据的线性模型
limmaGUI 1.3.9 GUI的limma软件包
LPE. 1.1.5 使用本地池误差(LPE)方法分析微阵列数据的方法
macat 1.2.0 微阵列染色体分析工具
Madb. 1.0.1 微阵列数据库和用于微阵列分析的实用功能。
made4 1.0.0 使用ADE4多变量分析微阵列数据
makecdfenv 1.5.2 CDF环境制造商
marray 1.6.3 双色斑点微阵列数据的探索性分析
matchprobes 1.0.22 阵列上探针序列匹配的工具
MCRestimate 1.2.6 交叉验证错误分类错误估计
MeasurementError.Cor. 1.0.2 相关系数的测量误差模型估计
MergeMaid 2.0.1 合并女仆
MIPP. 1.0.2 MIPP(错误分类罚款后部)基于分类
ml interfaces 1.0.10 ml interfaces
msbase 1.1.1 质谱大众清单操纵的基本类和方法。
mscalib. 1.0.2 质谱峰值(质量)列表的校准和滤波。
Multtest. 1.6.0 基于重采样的多假设检测
nnnorm. 1.1.0 基于强大神经网络的CDNA微阵列数据的空间和强度基于CDNA微阵列数据
奥林 1.3.3. 优化双色微阵列的局部强度依赖性标准化
olingui. 1.0.1 olin的图形用户界面
ontoTools 1.4.8 用于使用本体的图和稀疏矩阵;用于源头管理的命名法的正式对象
Birseqsim 1.0.4 成对序列对准相似性简单。
pamr 1.22 PAM:微阵列预测分析
pgUtils 1.0.3 PostgreSQL数据库的实用程序函数
Pickgene. 1.0.0 微阵列表达数据分析的自适应基因拣选
plgem 1.0.0 权力法全球错误模型
pl 1.0.0 实现Affymetrix PLIER算法
普拉达 1.3.1 基于细胞功能测定的数据分析
过程 1.3.4 密度密度加工
QValue. 1.1.0 错误发现率控制的q值估计
拉玛 1.0.1 微阵列的稳健分析
Rankprod. 1.0.0 鉴定差异表达基因的等级产品方法。
RBGL. 1.3.13 测试界面来提升C ++图形lib
RDBI. 1.1.2 通用数据库方法
rdbipgsql. 1.1.4 PostgreSQL访问
redostools. 1.5.19 用于R的存储库工具
救济服务器 1.1.2 从TIGR Resourcerer读取注释数据或将注释数据转换为Bioconductor数据包。
RFCDMIN. 1.0.0 RFLOFCYT示例的最小数据库
Rflowcyt. 1.0.1 用于流式细胞仪分析的统计工具和数据结构
Rgraphviz 1.5.10 为R图形对象提供绘图功能
rhdf5 1.4.1 R的HDF5接口
中华民国 1.1.1 ROC的公用事业,Uarray焦点
RSNPper 1.0.5 interface to chip.org::SNPper for snp相关数据
Ruuid 1.5.3 Ruuid:提供普遍唯一的ID值
安全 1.0.0 功能与表达的意义分析
SAGElyzer 1.5.2 处理Sage库的包
Sagenhaft. 1.0.0 读取和比较SAGE库的函数集合
siggenes 1.2.17 SAM和Efron的经验贝叶斯方法
simpleaff. 2.0.16 非常简单的Affymetrix数据高级分析
SNAData 1.1.1 社交网络分析数据示例
剪接 1.0.10 剪接
SpoteDiftation 1.1.1 微阵列点分割和网格用于微阵列斑点
SSIZE. 1.0.1 估计微arry样品尺寸
斯坦 1.0.9 微阵列数据的结构分析
stepNorm 1.0.2 cDNA微阵列的逐步归一化功能
t 1.0.2 平铺阵列的分析
TKWidgets. 1.5.23 基于RK小部件
1.1.0 局部错误发现率的估计
VSN. 1.6.3 微阵列数据的方差稳定和校准
webbioc 1.0.1 生物导体网界面
WidgetInvoke. 1.0.0 函数的评估小部件
widgetTools 1.4.7 创建一个交互式tcltk小部件
xcms 1.0.0 LC / MS和GC / MS数据分析