蒂格拉里

分析高密度寡核苷酸瓷砖阵列

该软件包提供了一些功能,这些功能可用于分析高密度平铺微阵列数据(例如Affymetrix Genechips),以测量转录本丰度和体系结构。软件包的主要功能是:用于表示线性数据系列的分区的类“分割”。使用既快速又精确的动态编程算法拟合分段常数模型的函数“段”,以及使用Strucchange软件包计算置信区间的“ condint”。用于生成漂亮图的功能“ plotalongchrom”。从一组参考杂交的探针序列响应调整的函数“标准比例”。

作者 Wolfgang Huber,Matt Ritchie,Joern Toedling
维护者 W. Huber

小插图(文档)

软件包下载

Ressionnorm.pdf
costmatrix.pdf
findsegments.pdf
分段.pdf
资源 tilingarray_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 tilingarray_1.12.0.zip
OS X二进制 tilingarray_1.12.0.tgz

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微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,可视化
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