---标题：“运行这个研讨会练习的另一种方法”作者：“hector corrada bravo”日期：“`r sys.date（）`”输出：html_document gignette：>％\ vignetteindexentry {vignette title}％\ gignetteengine{knitr :: Rarmmardown}％\ vignetteencoding {UTF-8} ---在本文档中，我们将研讨会的起始工作空间设置为在本地使用“EPivizrchart`包和Rstudio查看器”窗格在本地运行，以使其更易于使用。目标是为HG19添加基因轨道，与CpG岛的轨道，以及来自基因表达条形码项目的表达的热图。让我们用HG19开始应用程序作为基因轨道的参考。允许首先加载库```{r，eval = true}库（epivizrchart）库（homo.sapiens）库（epivizworkshop）```我们有一个名为环境的新元素。`Epiviz-Environmence`可以在当前工作区中的所有图表中刷新所有图表并管理数据。环境还允许您为所有儿童图表设置基因组位置。这将在这个小插图的尽头更清楚。首先，创建一个Epiviz enivornment``` {r} Epivizenv < - Epivezenv（Chr =“Chr11”，START = 34000000，END = 39000000）```LETS添加HG19参考基因轨道```{R} GENES_TRACK < -Epivizchart（homo.sapiens，parent = epivizenv）genes_track````，让我们添加此包中包含的CPG岛轨道。 ```{r} data(cgi_gr) cgi_track <- epivizChart(cgi_gr, parent=epivizEnv, datasource_name="CpG Islands") cgi_track ``` Now, let's add a heatmap with the gene expression barcode data ```{r} data(bcode_eset) bcode_hmap <- epivizChart(bcode_eset, parent=epivizEnv, datasource_name="Gene Expression Barcode", chart="HeatmapPlot") bcode_hmap ``` Finally lets visualize all the charts in the environment. ```{r} epivizEnv ```