2R.啰嗦
R Markdown是一种创作格式，可以轻松创建来自R的动态文档，演示文稿和报告。它结合了核心语法啰嗦（一种易于写的纯文本格式），具有嵌入式R.代码块。R.标记文件完全可重复的（每当潜在时，它们都可以自动再生R.代码或数据更改）。
本文档介绍R.基于的Markdown v2kn和Pandoc.，将Markdown转换为HTML和许多其他格式的Workhorse。我们将在HTML和PDF中集中生成此类文档，但其他格式和类型可用。
请注意，PDF输出需要完全安装TEX，并且Pandoc是需要安装在外面的第三方应用程序R.除非您使用Rstudio，否则将所有必要的捆绑在一起R.包裹和Pandoc.。
小费
我们还想使用MS Word作为输出文档，因为这会破坏重复性的支持。最终的编译文档仅用于呈现（其隐含的PDF文件的HTML）;编辑应在原始文档上执行，即
RMD.文件。
2.1安装
您可以从CRAN安装所需的包，如下所示：
install.packages（“knitr”）install.packages（“Rarmmardown”）这些包用Rstudio预安装。
2.2标记基础知识
下图，取自Rstudio Markdown（v2）教程使用RSTUDIO说明了基本的Markdown语法及其输出。
可以使用部分标题使用
======或者-----（分别为1和2级）或一个或多个＃（分别为1,2，......分别）。斜体和粗体字体使用一到两个定义
*在文本周围。Bullet列出项目以a开头
-。在线代码和逐字表达式被后蜱包围
`。代码块启动并以三个背面删除结尾。
开始一条线
>抵消文本。
2.3文件标题
R Markdown版本2使用可选的在其他事情中，标题为定义，其中标题，作者和输出格式R.标记文件。下面，我们想使用HTML.作为最终格式;用。。。来代替pdf_document.制作PDF报告。
---标题：“标题来到这里”作者：“您的姓名”日期：“2015年6月12日”输出：HTML_Document ---2.4从RMD.至HTML.（或者PDF.）
如果您使用的是Rstudio，则生成最终输出的最简单方法是打开您的RMD.文件并单击针织HTML（或者针织PDF.， …） 按钮。
从R.，你可以使用KNITR :: KNIT2HTML或者RAMARMDOWS ::渲染功能并给予RMD.源文件作为输入。
这两个选项都将首先使用
KNITR :: Knit.功能编织该文档并生成标记m包含代码输出的文件。将使用最终输出文件的渲染
markdown :: markdowntohtml.（的情况下KNITR :: KNIT2HTML）或最近的RAMARMDOWS ::渲染。
库（“KNITR”）KNIT2HTML（“my_rr_document.rmd”）库（“RAMMARMDOWN”）渲染（“my_rr_document.rmd”）##默认输出是HTML渲染（“my_rr_document.rmd”，output_format =“html_document”）用于使用PDF输出kn
KNIT2PDF（“my_rr_document.rmd”）或者rmakdown.
库（“Rarmmardown”）渲染（“my_rr_document.rmd”，output_format =“pdf_document”）并且，呈现标题中定义的所有输出格式
渲染（“my_rr_document.rmd”，output_format =“全部”）锻炼：试验
R.迄今为止描述的标记和特征。要创建起始文档，请创建一个新的r markdown.文件使用Rstudio菜单或复制/粘贴下面的模板。
---标题：“标题来到这里”作者：“你的姓名”日期：“2015年6月12日”输出：HTML_Document ---这是一个`R`标记文件。Markdown是用于创作HTML，PDF和MS Word文档的简单格式化语法。有关使用“r`的更多详细信息，请参阅。单击**针织**按钮时，将生成文档，其中包含内容以及文档中的任何嵌入式`r` ro块的输出。您可以嵌入如下所示的“R”代码块： 2.5更多Markdown语法
2.5.1.重点
您可以使用*或者_格式化斜体和大胆的文本。
*斜体* ** bold ** _italic___bold__2.5.2标题
##标题2 ###标题32.5.3清单
无序列表：
*项目1 *第2项+第2A +项目2B订购清单：
1.第1项2.第3项3.第3项+项目3A +第3B项2.5.4链接
要使用链接，请括在链接文本中[]和实际的链接（）：[我的链接]（http://linkul.com）或使用普通的HTTP地址：
http://example.com [链接短语]（http://example.com）2.5.5图片
要为文档添加静态图，请使用链接语法并在其之前！！：！[图像文本]（./ fig / myfig.png）。
图像源可以是在线或本地文件。
！[alt text]（http://example.com/logo.png）！[alt text]（数字/ img.png）2.5.6块报价
一位朋友曾经说过：
给予比收到总是更好的。
一位朋友曾经说过：>给予比收到更好。2.5.7普通代码
普通代码块以固定宽度字体显示，但未评估（见下文用于评估代码块），请使用3后退（参见上图）
此文本逐字显示/预格式化我们也可以定义排队使用单个背面的代码。
我们还可以使用单个背面定义“在线”代码。2.5.8横向规则/页面休息
三个或更多的星号或破折号：
****** ------2.5.9桌子
有一个简单的Markdown语法来生产可充分格式化的表：
| 第一标题 | 第二标题 |
|---|---|
| 内容细胞 | 内容细胞 |
| 内容细胞 | 内容细胞 |
| 内容细胞 | 内容细胞 |
这是由
第一标题|第二标题------------- |-------------内容细胞|内容细胞含量细胞|内容细胞含量细胞|内容细胞2.5.10嵌入方程式
您可以嵌入乳胶或MathML方程R.使用以下语法的Markdown文件：
$等式$对于内联方程式（注意，毗邻的白色空间一定不存在$分隔师）$$方程式$$显示方程式对于MathML方程。
例如：
2.5.11超级和下标
H2o是液体。210.是1024。
H〜2〜O是液体。2 ^ 10 ^是1024。锻炼：补充你
RMD.带有一些新语法元素的文件。
2.6R.代码块
包括R.代码在R.Markdown文件，本机代码Chunk语法在内部的代码块标记增强{r，...}，如下图所示：
以下代码块选项可用：
{r chunkname}第一个未命名的字符串用于命名代码块;对遵循代码执行和调试有用。{r，eval = true}默认情况下，执行块中的代码。或者，集合eval = false.。{r，echo = true}默认情况下，代码在输出之前显示。用echo = false.隐藏代码块内容。控制消息，警告或错误是否要显示
{r，message = true，警告= true，错误= true}或者错误的。可以控制图形尺寸
图..和Fig.Width.。为了避免浪费时间在重复一遍又一遍的长期计算时，可以缓存特定的代码块指定
缓存=真实在块标题中。要执行在线代码，请使用
`r 1 + 1`（前面没有空间R.， 尽管）。
表格可以轻松打印在代码块内。下面，我们明确创建和使用data.frame.。
DFR < - data.frame（名称= C（“John”，“David”，“Caroline”，“Igor”），ID = C（123,234,321,231），性别= C（“M”，“M“，”f“，”m“））DFR##名称ID性别## 1 John 123 M ## 2 David 234 M ## Caroline 321 F＃4 Igor 231米生产的表R.随着数据帧或矩阵可以用辅助功能呈现KNITR :: KABLE.然后相应地显示。
图书馆（“KNITR”）KABLE（DFR）| 名称 | ID | 性别 |
|---|---|---|
| 约翰 | 123. | m |
| 大卫 | 234. | m |
| 卡罗琳 | 321. | F |
| 伊戈尔 | 231. | m |
锻炼：使用
鸢尾花数据集，创建一个可重复的报告，记录数据（维度，摘要统计信息，......）并提供一组可视化（PCA绘图，对，......）。要结束您的报告，请添加一个会话信息截面的输出sessioninfo（）。