欢迎

生物导体贴纸

这是登陆页面“用生物导体编排单细胞分析”Book,它教用户一些常见的工作流以分析单细胞RNA-seq数据(SCRNA-SEQ)。这本书将向您展示如何利用尖端的生物导体工具来处理,分析,可视化和探索SCRNA-SEQ数据。此外,它是同名纸

你会学到什么

本书的目的是通过使用示例数据集的各个典型工作流程的各个步骤来使用生物通用器工具的使用来提供可靠的基础。我们努力解决手稿中涵盖的关键概念,“用生物导体编排单细胞分析”,每个工作流程都涵盖了各种细节,以及必要的预赛,对于与您自己的工作流程一起关注至关重要。

你不会学到什么

生物信息学分析的领域很大,并充满了许多潜在的轨迹,具体取决于所研究的生物系统和正在部署的技术。在这里,我们仅简要调查了用于分析SCRNA-SEQ的众多工具,重点是生物处理程序包。在一本书中,不可能彻底查看通过R和生物导体进行生物分析的大量工具,但我们希望为自己提供进一步探索的手段。

因此,毋庸置疑,您可能不会从我们的示例中学到自己数据的最佳工作流程 - 当我们努力提供高质量的模板时,应该将它们视为 - 一个模板可以扩展到您自己的分析中。

我们为谁写这篇文章

我们已经牢记感兴趣的实验生物学家写了这本书,并尽力对以前的编程或统计经验做出一些假设。同样,我们也欢迎更多经验丰富的生物信息学家,他们正在寻找一个从中潜入单细胞RNA-seq分析的起点。因此,我们欢迎任何和所有反馈改进本书,以帮助提高可访问性和完善技术细节。

为什么我们写这个

这本书是在2018年秋季构想的,随着单细胞RNA-seq分析在生物学领域的突出性上升。随着它的快速增长以及专门针对Scrna-Seq量身定制的生物导体内部的发展,很明显,对该公司的更新进行了更新使用生物导体编排高通量基因组分析纸对于单细胞研究的年龄是必需的。

我们努力突出称为生物导体为其工具的人的奇妙软件,并希望在此过程中展示整个生物导体社区,以不断推动生物学分析领域。